检查宿主和病原体基因组之间的差异

更好地理解导致感染和传播的机制

分子流行病学

分子流行病学描述了一个识别疾病遗传基础的过程,包括宿主和病原体内影响感染、传播和预防的变异。分子流行病学专家通常专注于确定感染源、追踪传播途径和识别与病毒毒力相关的基因d耐药性,以支持医院感染控制和流行病学调查。

下一代测序(NGS)允许对多个分离株进行高度精确的、无假设的分析以进行检测,取代了识别生物体、检查耐药性和毒力的多种测试。相比之下,传统的病原体鉴定和表征方法往往受到一系列假设的指导,只针对有限数量的微生物进行优化。

人类微生物组分析

分子流行病学专题文章

iSeq用于研究埃博拉爆发
埃博拉疫情的特征

结合广泛的流行病学调查结果,便携式iSeq 100系统使当地科学家能够分析传播模式并追踪暴发的源头。

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铜绿假单胞菌
细菌基因组测序监测感染

卫生保健获得性感染是一个主要的卫生保健问题。通过全面的分离、鉴别和定性,可以检测到疫情。

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冠状病毒
Illumina测序仪帮助描述和控制冠状病毒

正如发表在《新英格兰医学杂志》(New England Journal of Medicine)上的文章所述,Illumina NGS与其他技术相结合,用于对新型冠状病毒基因组进行测序。

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COVID-19测序

NGS在传染病监测和暴发模型中处于独特的地位。比较NGS方法并找到检测和表征SARS-CoV2、追踪传播途径、研究合并感染和调查病毒进化的解决方案。

亚博官网人口
COVID-19解决方案

NGS的一个关键优势是,研究人员可以生成能够识别一系列生物体(细菌、病毒和寄生虫)的基因组序列数据.研究基因组的变异有助于进行横断面研究,以更好地了解导致感染和传播的机制,并进行系统发育分析,以确定生物体之间的相关性。

使用全基因组测序数据进行高分辨率病原体分型可以区分许多旧方法无法区分的生物体。

微生物全基因组测序可以帮助流行病学家克服追踪疾病起源和调查疫情的传统挑战。

跟踪致病性变化

詹尼弗·加迪(Jennifer Gardy)博士解释了NGS是如何为公共卫生工作增加力量的,以及它如何被用于重建加拿大不列颠哥伦比亚省爆发的结核病,让我们了解基因组流行病学。

阅读文章:要赶在下一次疫情爆发之前

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呼吸道病毒寡聚物小组

对包括COVID-19毒株在内的常见呼吸道病毒进行高灵敏度检测和表征,并进行全面、快速的目标富集测序。

呼吸道病原体ID/AMR面板

这个基于ngs的工作流程针对呼吸道病原体和抗菌素耐药性等位基因,并提供了由IDbyDNA支持的简化数据分析。

新冠病毒-19软件工具

加速冠状病毒的检测和识别,执行宿主反应研究,简化样本跟踪,并免费向公共数据库捐款。

COVIDSeq测试扩展到更多客户
COVIDSeq测试扩展到更多客户

FDA第二项修正案利用了额外的Illumina测序仪用于COVID-19检测

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マイクロバイオーム研究の時代の到来
マイクロバイオーム研究の時代の到来

全ゲノムショットガンシーケンスとトランスクリプトミクスからは,研究者や製薬会社が創薬を精密化するためのデータを得ることができます。

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在SPARK将聪明人聚集在一起
在SPARK将聪明人聚集在一起

基因组学、医疗保健和技术领域的知名人士齐聚Illumina首届全球创意论坛SPARK

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兽医流行病学研究进展

Tony Goldberg和Sam Sibley讨论了NGS如何推动兽医传染病流行病学的进展。

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使用NGS追踪流感

yobet亚洲了解泰国AFRIMS开发的使用MiSeq追踪流感的无培养方法。

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中国H7N9流感监测

阅读江苏省疾控中心的研究人员是如何使用MiSeq监测H7N9流感的。

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NGS用于微生物基因组和感染控制
耐药细菌流行病学

研究人员利用NGS来了解耐甲氧西林药物的进化和传播金黄色葡萄球菌

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参考文献
  1. Prosperi M、Veras N、Azarian T、Rathore M、Nolan D等(2013年)基因组时代社区相关耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的分子流行病学:一项横断面研究。科学代表3:1902。
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