2020/08/26
NovaSeq在输出能力和降低每次读取成本方面是一个重大飞跃。
在推出其最强大的音序器三年多后,Illumina安装了1000台thNovaseq 6000排序系统。2020年6月,马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州剑桥的Bibewhife研究所的序列机。
怀特黑德的研究人员是基因组测序技术的早期采用者,他们热切地欢迎SOLEX.序列仪于2007年。“伊利姆纳几个月后购买了Solexa,”Thomas Volkert表示,他指导Whitehead的基因组技术核心。“他们所做的第一件事之一是进来脱掉索勒塞品牌并穿上自己的皮肤。我的遗憾之一是,我没有抓住那种索尔岛机器的东西。这将是一个如此伟大的收藏品。“
“这是我们的第一个,”他继续说道,“但不到三四个月,我们就意识到我们需要第二个。”从那里,实验室升级到HiSeq测序仪,并使用HiSeq 2500多年,然后决定购买NovaSeq 6000 - 1000thNovaseq Illumina已经放置。
把它工作
新的NovaSeq 6000建立在Whitehead漫长的基因组发现记录的基础上。杨实验室使用了核心的三个HiSeq测序仪,利用染色质免疫沉淀(ChIP)和其他技术来研究转录调控。
大卫页面,谁将Whitehead为15年,使用RNA-SEQ研究基因表达。他特别想了解特定组织中的基因组在男性和女性方面是否表现得不同。
最近,白头研究人员已经开始研究肺如何对单细胞水平的冠状病毒和其他感染的回应。这种对单细胞测序的蓬勃发展的兴趣是使Novaseq 6000购买的若干动机之一。
“Novaseq是输出能力方面的重大飞跃,并降低每台读取的成本,”Volkert说。“我们基本上通过获取这台机器来削减单细胞测序的价格,这是巨大的。”
增加可达性
在放置其1000的过程中thIllumina宣布了另一个历史性里程碑:600美元的基因组。NovaSeq 6000 v1.5试剂盒实现了这一点,当与NovaSeq 6000一起使用时,它可以以极大的灵活性、准确性和规模加速科学突破。
随着600美元基因组的引入,像Whitehead这样的实验室将受益。Volkert说:“降低成本只会导致人们的实验设计规模变得更大。”“在NGS领域,价格一直是一个因素,而实验设计经常因为资金不足而被削减。降低成本将使研究人员能够从事他们真正想做的事情,而不仅仅是他们负担得起的事情。”