对我们北半球的大多数人来说,空气中的寒冷和白天的缩短预示着秋天,一个变化的季节。基因组学与通常与秋天有关的自然和人为现象有什么关系?其中一个研究领域称为转录组学——研究细胞内的所有RNA分子,也称为转录组。这项研究考察了基因组表达的初始产物——一组来自转录组的RNA分子。对于尚未被广泛研究的生物体和没有参考序列的生物体,全转录组测序已经成为表征基因和理解基因表达模式的有效方法。请继续阅读三个有趣的例子,说明最近的研究如何帮助我们理解不断变化的世界的生物学,也许有一天会帮助我们过上更好的生活。
丰富多彩的变化
秋天的森林呈现出令人眼花缭乱的景象,把树冠变成了黄色、橙色、红色和紫色的马赛克。科学家正在利用转录组学揭示这些过程背后的细胞机制。整个夏天都处于休眠和未使用状态的特定基因开始“启动”,随着营养物质被消化和重新吸收,在衰老过程中产生新的色素,叶片中出现了一系列活动。
丰富的收获
收获时节是丰收的时节,因为农民们带来了大量成熟、美丽的庄稼。转录组学的进步使作物科学家能够研究基因在作物成熟时是如何关闭和开启的,并让我们更好地了解这一过程是如何工作的,以及受到各种气候和环境因素的影响。更好地了解水果成熟背后的遗传学,可以帮助农民在不断变化的世界中将最美味、最可持续的作物推向市场。
发冷
在没有食物的情况下,冬眠的哺乳动物必须依靠脂肪储备,因为心率急剧下降,肌肉实际上几个月都处于闲置状态。人们对哺乳动物的冬眠了解甚少,部分原因是没有科学模型物种冬眠。但新的转录组学技术,比如RNA-Seq,可以一次性测量数千个基因的调控变化,让我们对冬眠动物发生的戏剧性变化的生物学有了强有力的了解。总有一天,理解假死可能对执行长时间太空任务的人类有用,或提高某些创伤条件下的存活率。
来源
- 关键词:红槭,转录组,基因工程,着色,基因工程引用本文:BMC植物生物学。2019.
- Wyatt LE, Strickler SR, Mueller LA, Mazourek M.一种橡实南瓜(西葫芦。卵)瓜类果实和种子转录组是研究瓜类果实性状的资源。园艺研究。2015年1月28日;2:14070.
- Hampton M, Melvin RG, Kendall AH, Kirkpatrick BR, Peterson N, Andrews MT.转录组深度测序揭示了冬眠哺乳动物的季节性适应机制。PloS one。2011年10月28日,6 (10):e27021。
- 施瓦茨C,汉普顿M,安德鲁斯山。冬眠哺乳动物大脑中基因表达的季节性和区域性差异。公共科学图书馆一号。2013年3月20日;8(3):e58427
- https://www.nytimes.com/2019/11/15/science/hibernation-bears-winter-health.html