![研究人员获得宽吻海豚基因组](http://www.169o.com/jp/content/dam/illumina-marketing/images/company/featured-articles/bottlenose_dolphin.png)
2018/09/12
大西洋宽吻海豚(截形土荆芥)已经完成,并由来自Illumina, Inc., Sea World, Plant with Purpose,yobet亚洲NRGene约翰霍普金斯大学和海洋发现研究所。像这样的高质量基因组对于解决育种、比较生物学、医学和保护规划方面的挑战至关重要。这基因组组装,就像夏威夷僧海豹和非洲野狗一样,这本书的出版旨在促进比较基因组学的研究,为生物多样性编目提供结构,并最终支持物种保护和管理决策。
通过这个项目,科学家们采用了多种方法来改善大西洋宽吻海豚的组装结构。现在有两种基因组组合:
1)传统的“单倍体”装配(Tur_tru_Illumina_hap_v1) -两个亲本单倍型的典型嵌合体
单倍体装配可在以下位置获得:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA476133
2)Haplotype-Phased“二倍体”组装(Tur_tru_Illumina_dip_v1)-每个支架代表一个同源染色体的序列
分阶段从头组装是最高质量的,并为社区提供了新颖和准确的方法来探索海豚基因组的杂合子性质。二倍体装配在这里可用:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA478376
宽吻海豚是被广泛研究的海洋哺乳动物之一。然而,其分类学语属仍未得到解决。为了将这个物种引入基因组学的时代,高质量的参考基因组是至关重要的,因为它提供了在整个基因组水平上对物种内部和物种之间的多样性进行分类的结构。此外,海豚和其他哺乳动物之间的平行分子轨迹使宽吻海豚成为一个有用的模型,以了解人类健康的各个方面,如代谢过程/糖尿病、蛋白质组学和衰老。有关如何收集数据以及高数据质量的详细信息,请阅读这篇论文.