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将COVID监测功能扩展到大城市以外

随着COVIDSeq检测的首次出现,小型实验室正在参与监测

将COVID监测功能扩展到大城市以外
2021/07/27

“上个月,我们出现了大流行开始以来(阳性COVID - 19病例)的最大峰值,”世卫组织卫生主任阿德里安·亚历杭德罗·塞巴洛斯López博士说Biomedicos de梅里达.Biomédicos是墨西哥南部地区唯一一家采用测序技术进行临床应用的实验室,该地区的经济差异非常大。但在新的Illumina到来之前COVIDSeq™试验他们还没有对SARS-CoV-2病毒进行测序。Biomédicos是世界上最早使用96样本分析的客户之一。在收到试剂盒的几天内,他们对21个样本进行了测序,并在该地区发现了15个Gamma和3个Alpha变体。

在尤卡坦州,有相当数量的来自美国和加拿大的退休退伍军人,以及参观梅里达和坎昆附近的游客。塞巴洛斯·洛佩斯想知道游客是否会带来变种。“我觉得很有可能我们在该地区发现了α型或δ型变异病毒。目前在墨西哥,没有强制性的新冠病毒检测进入该国。仍然必须戴口罩。”现在他可以对SARS-CoV-2进行测序,他将能够识别病毒源。

“我们的老年人已经接受了全面的疫苗接种,但40至60岁的人只接受了第一剂。我们需要进行测序,因为我们观察到病毒很容易传播,年轻患者病情更严重。”

Biomédicos迫切希望启动测序,在其所在地区检测SARS-CoV-2。该实验室服务于墨西哥的东南端,包括Yucatán、恰帕斯、塔巴斯科、坎佩切、金塔纳鲁奥。该实验室还为邻国伯利兹提供服务。

买了一辆IlluminaMiSeq™在2020年底,Ceballos López对使用新技术感到兴奋COVIDSeq™试验该项目允许小型实验室参与监控。COVIDSeq Assay试剂盒提供试剂,可在MiSeq™、MiniSeq™和iSeq™100系统上准备多达96个样品进行测序,是NovaSeq™6000上的3,072个样品或NextSeq™上的384个样品的更易于管理的替代方案500/550/550Dx/2000

Ceballos López说:“我们将能够识别具有临床意义的变异,也许是一种新的变异。”。

今天,有超过1.91亿COVID-19病例全世界报道。许多国家正在对其阳性病例进行排序并报告变异,以支持公共卫生管理。但大多数现有的基因组数据来自大型基因组中心,这些中心的实验室具有高通量样本处理能力,而投资于高通量测序仪的资源有限的国家向新冠病毒监测网络提交的数据较少。

COVIDSeq分析为低通量和中通量实验室提供了在较小规模上进行非集中监测的途径,以对病毒变异进行排序和识别,从而帮助公共卫生机构管理COVID-19大流行。加强对新出现和流行变异的监测对于全球控制病毒变异的努力至关重要罗斯。

有关MiSeq、MiniSeq和iSeq 100系统的新96样本COVIDSeq分析的信息,请单击在这里

要了解yobet亚洲亚博官网人口有关NovaSeq 6000和NextSeq 500/550/550Dx/2000的COVIDSeq的更多信息,请单击在这里

要阅读有关识别和跟踪传染病威胁的信息,请单击在这里

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