Illumina和SPHCC在上海推进NGS的研究

当2019年底冠状病毒爆发时，上海公共卫生临床中心(SPHCC)的P3生物安全实验室研究团队部署了Illumina MiniSeq™用于患者样本的深度转录组测序。SPHCC也率先公布了SARS-CoV-2的基因组序列，包括其临床、流行病学和生物学特征，为初步了解病毒赢得了宝贵的时间。

作为中国领先的病原微生物和传染病研究机构，SPHCC在公共卫生保护和研究中发挥着重要作用。为了积极有效地预防未来的传染病，SPHCC正在开发一个全面的公共卫生预警系统，这需要对病原微生物有深入的了解。

考虑到这一项目和其他项目，SPHCC和Illumina最近在中国上海成立了SPHCC-Illumina微生物测序研究和应用示范中心。该中心的主要目的是促进病原微生物的研究和临床试验，开展学术交流和培养全国范围内的人才。Illumina将提供技术支持、培训和学术交流。双方都将推动下一代测序(NGS)技术。

NGS是病原微生物检测的基石，在指导重大研究发现中发挥着关键作用。Illumina领先的技术可以帮助我们更快、更准确地了解传染病的传播途径、并发症、突变率等重要信息。”“这为疫苗开发和临床诊断和治疗奠定了坚实的基础;它将帮助我们预测和预防未来的流行病，并为预防和治疗传染病的战略规划提供科学依据。”

Illumina副总裁兼大中华区总经理Li Qing表示:“Illumina长期以来一直活跃在病原微生物领域，我们期待与SPHCC合作，以扩大对NGS的认识，并在未来扩展基于NGS的应用。”“我们相信，这些努力最终将有助于中国的长期公共卫生。”

在大流行期间，Illumina的NGS技术正在全球范围内被用于支持研究，包括治疗和疫苗开发、诊断、筛查和监测应用。例如，英国剑桥的Illumina实验室正在与英国基因组公司(Genomics England)合作，对多达3.5万名COVID-19患者的基因组进行测序;研究人员将检查患者对感染的各种反应，从中度到重度。在新德里，基因组学和综合生物学研究所已经验证了Illumina的covid - seq检测方法。在实验室之外，Illumina在四大洲开展了实地捐助，包括在疫情暴发之初为武汉捐赠200万元人民币的紧急医疗物资。