2016/04/18
的Illumina公司MiniSeq系统这是该公司迄今为止最小、最简单的下一代测序(NGS)系统。推出Go Mini科学挑战项目是为了突出利用Illumina最实惠的测序器可以执行的应用范围。今天，在美国癌症研究协会(AACR)于路易斯安那州新奥尔良举行的年度会议上，在收到了来自世界各地的1100多份拨款申请后，获奖者被宣布。
一等奖得主Mattia Prosperi, m.e Eng, Ph.D，佛罗里达大学公共卫生与卫生专业学院和医学院流行病学系副教授，将获得一台MiniSeq，一台2016年MINI Cooper，以及三次测序所需的试剂。作为公共卫生学院跨学科团队的一员，他计划通过对在驾驶MINI Cooper时收集的蚊子的DNA测序来研究蚊子传播的病原体，以了解病原体是如何在佛罗里达州传播的。这辆车也将被用作一个叫做HealthStreet为医疗服务不足的人口提供免费交通。
普洛斯佩里博士说:“我很荣幸能够赢得这项科学挑战，并能够在我对佛罗里达州目前存在的病原体多样性的研究中实施下一代测序。”“通过收集车上的细菌样本，我们的目标是在地理上绘制全州发现的病媒和病原体，使公共卫生官员能够实施感染控制项目。”
二等奖获得者Hongmei Li-Byarlay博士是北卡罗来纳州立大学国家研究委员会的博士后研究员，他将获得一个MiniSeq和三次测序所需的试剂。她计划对蜜蜂基因组进行排序，并通过调查蜜蜂免疫系统的潜在遗传和表观遗传成分，进一步研究昆虫的免疫系统。她认为，MiniSeq是这项研究的理想平台，因为靶向RNA测序和全转录组测序将有助于更好地理解抗病毒免疫反应途径，并深入了解病毒感染后的基因调控和表观遗传变化。
“很多人没有意识到蜜蜂对我们的经济和食物供应的重要性。大多数(87%)开花作物需要蜜蜂等传粉者的帮助。这些农作物和植物相当于人类食物消费的33%。蜜蜂授粉支持了价值约150亿美元的农业生产，包括美国经济中的许多水果和蔬菜(如蓝莓、鳄梨、西瓜和南瓜)，”Li-Byarlay博士说。“我们观察到，由于自然病原体和寄生虫，每年有30%至40%的种群减少，我希望我的研究可以帮助预防这种情况。”
第三名得主，Una McVeigh，爱尔兰国立大学(NUI)戈尔韦的博士生，将在Illumina推动的MiniSeq上进行三次测序。她将研究西爱尔兰人群的乳腺癌基因，特别是具有强烈家族病史的女性，以了解除BRCA 1和BRCA 2以外的基因在癌症易感性中的作用。她的转化研究利用了国立大学高威外科的一个大型生物银行的样本，旨在确定遗传变异的频率，它们对乳腺癌风险的影响，以及对它们进行检测的临床用途。她希望能够验证新的临床相关变异，这些变异可能适用于更广泛的人群。
“下一代测序是识别新的癌症易感性基因的宝贵工具，”麦克维说。“尽管发现了BRCA 1和BRCA 2，但大多数遗传易感性乳腺癌仍未得到解释。我们希望我们的研究可以开始识别乳腺癌的新基因驱动因素，以便有一天更好的患者筛查可以改善遗传易感人群的健康状况。”
Illumina全球营销副总裁Sam Raha说:“我们收到的科学挑战应用的多样性和创造力证明了MiniSeq的多功能性。“我们很高兴通过这些研究人员的工作，MiniSeq将被用于推进昆虫学、病毒学和肿瘤学的科学理解，并期待看到我们的其他客户在改善人类健康的众多关键应用程序上使用该系统。”
MiniSeq定价49,500美元，可提供许多集成的工作流程，包括机载数据分析工具，使其成为测序技术新采集者的一个很好的NGS入口点。它非常适合癌症、传染病、遗传疾病和生殖健康等领域的研究和工业应用。具有已证实的工作流程的常见应用包括靶向表达谱、miRNA发现、靶向因果变异筛选、固体和血液学谱以及种系筛选。
MINI和MINI Cooper是MINI USA(宝马北美有限责任公司的一个分支)的商标。Illumina不受MINI USA赞助，不与MINI USA相关，也不隶属于MINI USA。
