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视频:Illumina站在大流行的前线

回顾一下我们如何部署新一代测序以支持全球监测

Illumina站在大流行的前线
2021/08/26

这个月,,Illumina向分子诊断参考实验室捐赠了100万美元的测序能力在大孟买市政公司运营的卡斯图巴医院。卡斯图巴位于印度马哈拉施特拉邦,那里有600多万例新冠病毒感染病例,他知道基因组监测是一个关键工具。作为一家全球生命科学公司,Illumina的使命是支持改善健康和生活质量。在这次大流行期间,这一使命被放大了一百倍。目前,Illumina支持70多个国家的新冠病毒监测。

从一开始就排序
2020年1月24日清晨,当他们的家人准备庆祝中国新年时,Illumina在中国的员工正在收拾行李下一步™ 550测序器将交付给中国疾病预防控制中心(CCDC)。之后,团队校准了仪器并培训了CCDC员工。这些机器对于帮助中国科学家和公共卫生官员更好地了解正在出现的冠状病毒至关重要。

Illumina从第一天起就采取了实际操作的方法:向客户提供产品、工作流程和支持;实现数据和样本共享;为客户实验室配备人员以帮助他们扩大规模;捐赠和折扣用品。

我们的员工与CCDC、盖茨基金会、美国疾控中心、非洲疾控中心、巴斯德研究所、制药和生物技术公司以及许多其他机构密切合作,帮助监测和控制病毒。由于Illumina测序技术是全球NGS标准,我们为所有这些集团提供了一个共享信息的通用语言。

NGS在流行病学研究、分析感染群、识别共病、验证诊断、评估不同菌株及其演变过程中发挥了至关重要的作用。这些片段对于理解疾病、测试治疗和开发疫苗至关重要。亚博下载app

最早的努力
甚至在Illumina向CCDC交付NextSeq系统之前,我们的仪器就已经帮助公共卫生官员抗击疫情。2019年12月,上海公共卫生临床中心(SPHCC)部署了MiniSeq系统对患者样本进行排序。SPHCC是最早公布病毒基因组序列的公司之一。

后来,我们打开了门SPHCC-Illumina微生物测序研究与应用示范中心在上海加快微生物学研究和临床试验。

2020年4月,我们推出了Illumina SARS-CoV-2数据工具包,这是一套新的数据分析和工作流程工具,可以更容易地识别患者样本中的SARS-CoV-2序列,并与公共数据库共享这些发现。

为了加速采用,Illumina最初免费向全球研究界分发了该工具包。这些工具整合了全球15000个Illumina测序系统,为共享信息、了解传播途径、跟踪病毒进化以及确定病毒突变是否影响治疗效果提供了令人难以置信的资源。

这个月晚些时候,Illumina捐赠了140万美元向非洲联盟委员会提供测序系统和耗材,以扩大在刚果民主共和国、埃及、埃塞俄比亚、加纳、肯尼亚、马里、尼日利亚、塞内加尔、南非和乌干达的SARS-CoV-2测序。

5月Ilumina和Illumina公司基金会承诺1000万美元支持抗新冠病毒工作●500万美元用于支持SARS-CoV-2监测、测序和监测的仪器和耗材$200万用于新冠病毒-19相关研究$100万到疾控中心基金会急诊科应急基金;以及200万美元的社区倡议。

在英国,Illumina与英国基因组学合作对约35000名新冠病毒-19患者进行测序。该计划的目的是揭示新冠病毒-19易感性的遗传因素。

新冠病毒检测和监控
6月9日,我们的高通量COVIDSeq™试验获得了FDA的紧急使用授权,为实验室提供了一种新的NGS工具,用于扩大诊断测试。后来,我们发布了柯维塞克™ 化验,我们的研究只使用了运行在MiSeq, MiniSeq和iSeq100系统上的面板。这种新的化验方法虽然不是一种诊断方法,但使小型、分散的实验室能够检测和跟踪病毒——这在没有研究或监测网络的发展中国家是一种特殊需要。

在实验室之外,Illumina在四大洲做出了实地贡献。与比尔和梅林达盖茨基金会合作,Illumina承诺向全球病原体基因组计划提供6000万美元的测序能力,它扩展了非洲病原体基因组学倡议,帮助在世界各地建立一个全面的病原体基因组网络。

COVIDSeq尚未获得FDA的批准或批准。该试验由FDA根据EUA授权,在声明存在证明授权紧急使用体外诊断检测和/或诊断COVID-19的情况下进行。COVIDSeq仅授权在美国实验室使用,并根据e 1988年临床实验室改进修正案(CLIA),42 U.S.C.§263a,用于执行高复杂性试验。亚博下载app

有关MiSeq、MiniSeq和iSeq 100系统的新96-sample COVIDSeq Assay的信息,请单击在这里.

要了解yobet亚洲亚博官网人口关于NovaSeq 6000和NextSeq 500/550/550Dx/2000的COVIDSeq的更多信息,请单击在这里.

要阅读有关支持新冠病毒-19监测的信息,请单击在这里.

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