2017/06/13
7月，斯德哥尔摩将主办第三届地铁和城市生物群落的元基因组学和元设计（MetaSUB）年会，该年会将汇集致力于绘制全球67多个城市的城市元基因组图的研究人员。
这一雄心勃勃的项目始于两年前，当时克里斯托弗·梅森教授和他的团队，为纽约市创建了第一个基于表面的城市规模微生物组和元基因组研究。该项目利用DNA数据，研究了这种“城市微生物组”如何随天气、清洁度、建筑材料甚至社区社会经济水平等变量而变化。该团队试图在纽约市建立基线概况ubway系统，识别潜在的生物威胁，并提供城市可用于创建“智能城市”的额外数据级别，即使用数据改善城市规划、管理和人类健康。值得注意的是，近一半（48%）的数据被测序的DNA序列中有一部分与已知的生物体不匹配，这突出了乘客周围每天都有大量的微生物群。
纽约市地铁项目只是一个开始，导致成立了一个国际实验室联盟，以建立全球公共交通系统微生物群的“DNA图谱”，Illumina是该项目的工业合作伙伴。
我们赶上了斯德哥尔摩大学的Klas Udekwu，他正在瑞典努力探索Illumina的下一代测序是如何实现这项研究的，并听取他如何将项目的范围扩大到非洲的尼日利亚。
