利用呼吸病毒Oligo Panel和Illumina RNA Prep with Enrichment,研究人员可以获得下一代测序(NGS)数据,可以确认SARS-CoV-2的存在,并推进变异分析研究。这种不可知的设计可以广泛识别致病性呼吸道病毒。
通过混合捕获方法靶向富集允许高度敏感的检测,而不需要霰弹枪代理测序所需的高读取深度。此外,该方法允许目标的近乎完整的序列数据,并打开诸如病毒演化或病毒监测的变体分析的应用。1
与其他靶向ReseReNEncing方法相比,例如扩增子测序,通过混合捕获的富集允许具有更全面的目标区域的探测器的巨大探针面板。另外,即使在高度诱变的区域内,用于杂交捕获方案的寡核苷酸探针仍然有效,允许靶向快速发展的病毒,例如RNA病毒。
这种综合工作流程集成样品制备,图书馆制备,靶向富集,测序和数据分析。工作流程旨在通过总核酸提取来丰富病毒靶。
提取的RNA用Illumina RNA Prep with Enrichment进行逆转录和文库制备,然后用Illumina Respiratory Virus Oligo Panel富集。在Illumina NGS系统上测序后,使用DRAGEN病原体检测管道和IDbyDNA Explify平台进行数据分析。
呼吸道病毒Oligo面板 | 呼吸系统病原体ID/AMR富集面板试剂盒 | |
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自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
物种分类 | 人类,病毒 | 细菌,病毒 |
系统兼容性 | MiniSeq那MiSeq那NextSeq 550 | MiniSeq那MiSeq那NextSeq 550 |
使用Illumina富集RNA Prep检测和鉴定呼吸道病毒,包括SARS-CoV-2
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使用MiniSeq快速试剂试剂盒和Illumina富集RNA试剂盒快速检测呼吸道病毒
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