Illumina RNA浓缩Prep
優れたキャプチャー効率とカバレッジ均一性を保ちながら,膨大な数のターゲット遺伝子を迅速に狙って解析できます。阅读更多…
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Illumina RNA文库与富集训练准备
20044763
合計：
Illumina RNA文库与富集训练准备
20044763
Illumina公司RNA预科与浓缩はビーズ上でのタグメンテーション技術を使用しシンプルな1回のハイブリダイゼーションを行うことで,RNAベースのライブラリー調製および濃縮を極めて迅速なワークフローにしています。
総所要時間9時間以内,ハンズオンタイム2時間以内でライブラリー調製と濃縮ができます。このワークフローで,TruSeq RNA外显子组と比べ50%超の時間が節約できます。イルミナ認定の自動化オプションは,当社の自動化パートナーを通じてまもなく利用できます。
新鮮/凍結サンプルのトータルRNAであれば10 ng,分解サンプル(FFPEなど)のトータルRNAでも20 ngほどの少量で高感度を達成できます。
ターゲットトランスクリプトームのコード領域だけを対象とすることにより,わずかなシーケンス深度で最大の検出力が得られます。Illumina RNA浓缩Prepは、優れたキャプチャー効率とカバレッジ均一性をもたらし、バイアスを入れず精確に検出するために必要なシーケンス深度を最小化できるように作られています。各濃縮反応には、わずか2.5 µLのプローブが必要です。
さまざまな既製の検証済みプローブプールから選ぶことも,独自のプローブをカスタマイズすることもでき,最大限の柔軟性があります。新しくなったユニークデュアルインデックス集CとD(近日発売予定)により,1回のランで最大384サンプルのマルチプレックスが可能です。目的とする領域の幅広いRNA-Seqアプリケーションに対応するモジュール設計で,アリル特異的発現解析,遺伝子融合検出,バイオマーカースクリーニングなど,さまざまな検出や探索が可能です。
RNAエクソームを含む膨大な数のターゲット遺伝子を迅速に狙って解析します。Illumina RNA浓缩Prepに、コーディングRNA配列を網羅的にカバーする高度に最適化されたプローブセット、Illumina Exome Panelを組み合わせることもできます。Illumina Exome Panelには425,000を超えるプローブが含まれます。各プローブはNCBI37/hg19のリファレンスゲノムに対して構築され、RefSeqエクソームの98%超を網羅しています。このプローブセットで、目的とする21,415個の遺伝子に及ぶ214,000個を超えるターゲットをキャプチャーできます。
呼吸道病毒益生元面板はコロナウイルス株を含む一般的な呼吸器系ウイルスの高感度検出と特性解析が可能です。ハイブリキャプチャー法によるターゲット濃縮に使用するオリゴプローブは,高変異領域内であっても効率的なため,急速に進化するRNAウイルスをターゲットにすることができます。呼吸道病毒益生元面板はIllumina公司RNA预科与浓缩と組み合わせて使用します。
詳細はこちら| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 中期输出:5 高输出:16 (基于每个样本25M读取) |
2 × 100 bp |
| NextSeq 2000系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 P2: 16 P3: 40 (基于每个样本25M读取) |
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4: 384 (基于每个样本25M读取) |
2 × 100 bp |
| MiSeq系统,MiSeq | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 多达25个样品(基于1M读取每个样品) |
2 × 75 bp |
| MiniSeq系统 | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 多达25个样品(基于1M读取每个样品) |
2 × 75 bp |
| NextSeq 550系统 | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 多达384个样本(基于每个样本1M的读取) |
2 × 75 bp |
| Illumina RNA浓缩Prep | TruSeq RNA外显子组 | Illumina链mRNA准备 | |
|---|---|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 方法 | 信使rna序列，目标浓缩目标浓缩,有针对性的RNA序列 | 外显子组测序，信使rna序列 | 信使rna序列 |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
| 变量类 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录变体 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 |
ビーズ上でのタグメンテーションと90分間1回のハイブリダイゼーションステップの組み合わせにより,TruSeq RNA外显子组に比べて迅速でステップ数の少ないワークフローが実現します。
Illumina公司RNA与浓缩は预科,人类的普遍参考(表)から抽出したトータルRNAのインプット量,10 ngと100 ngとの間で,高いデータ一致率を示しました。表RNAライブラリーをNovaSeq 6000システムでシーケンスし,ライブラリーあたり25米クラスターにサブサンプリングしました。データをBaseSpace RNA-Seq对齐v 1.1.1アプリケーションで解析しました。
Illumina公司RNA预科与浓缩とIllumina公司外显子组面板を使用してk - 562細胞株由来のRNA 10 ngから調製したライブラリーで,bcr - abl1遺伝子融合の検出に成功しました。上のアライメントトラックはすべてのリードを示し,下のアライメントトラックはbcr - abl1融合遺伝子を裏付けるリードのみを示しています。
| 融合(ソース) | RIN | RNAインプット量 | 検出結果 |
|---|---|---|---|
| bcr - abl 1(k - 562) | 7．4 | 10 ng | 6レプリケート中6例(100%) |
| TPM3-NTRK1(大腸がん) | 2．5 | 20 ng | 6レプリケート中6例(100%) |
Illumina公司RNA预科与浓缩とIllumina公司外显子组面板を使用して表RNA 10 ngおよびFFPE RNA 20 ngから調製したライブラリーでは,85%を超えるデータが転写領域(コーディングおよびUTR)にアライメントを示しました。比較対象として,TruSeq RNA外显子组を使用したライブラリーのデータを提示しています。
利用MiniSeq系统全面快速检测呼吸道病原体和相关耐药基因
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使用Illumina富集RNA Prep检测和鉴定呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2
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使用MiniSeq快速试剂试剂盒和Illumina富集RNA试剂盒快速检测呼吸道病毒
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小册子| PDF1 MB
小册子| PDF2 MB
数据表| PDF6版本
数据表| PDF< 1mb
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インプット量わずか25 ngの標準(未分解)RNAを利用してコーディングトランスクリプトームを解析できるシンプルで拡張性が高くコスト効率の良い,1日で完了できる迅速ソリューション。
コーディングおよびノンコーディングトランスクリプトーム研究用の広範な種類のサンプルから迅速にライブラリーを調製して,他に類を見ない柔軟性を持って研究を行うことができます。
遺伝子発現解析のためのターゲットRNAアッセイ:カスタムシーケンスパネルまたは設計済みのシーケンスパネルをご利用いただけます。必要なRNAは50 ngだけで,自動化されたデータ解析を行うことができます。
