TruSight肿瘤UMI试剂
下一代测序库的唯一分子标识(UMIs)纠错。阅读更多。。。
TruSight Oncology UMI试剂可降低测序数据中的背景噪声，从而能够检测低频变异，如在无细胞DNA（cfDNA）中发现的变异。
循环肿瘤DNA（ctDNA）可能代表cfDNA的一小部分，接近下一代测序（NGS）的检测极限。TruSight Oncology UMI试剂通过UMIs和纠错软件解决这一挑战，将错误率降低到<0.007%，并能够检测低频变异。较低的错误率增加了分析特异性，从而提高了NGS数据的可信度。
TruSight肿瘤UMI试剂包括UMI适配器和指标，加上TruSight肿瘤DNA库准备和富集试剂。这些试剂也可以与TruSight Tumor 170 DNA寡聚体配对。集成ui不会在库准备工作流程中创建任何额外的步骤。
UMI纠错应用程序对齐读取，然后使用UMI排除误报，从而减少各种调用错误。UMI纠错应用程序可在基于云的BaseSpace Sequence Hub中使用，也可在本地安装。
为了能够准确检测罕见变异，UMIs与纠错软件集成，使真实突变与背景噪声区分开来。底部面板说明了通过消除导致误报的固有错误，降低的错误率如何允许真实突变（红点）以便更好地与背景噪声（灰点）区分。
| 顺序运行 | 平均错误率（未压缩读取） | 平均错误率（折叠读取） |
|---|---|---|
| 1 | 0.038% | 0.0023% |
| 2 | 0.043% | 0.0024% |
| 3. | 0.035% | 0.0024% |
| 4 | 0.084% | 0.0019% |
使用TruSight Oncology UMI试剂和TruSight Tumor 170 DNA分析中的DNA含量进行文库制备，并在HiSeq 4000系统上的四次独立测序运行中分配31个样本。使用UMI错误校正应用程序显示有无折叠读取的平均错误率。
技术说明| PDF<1 MB
使用TruSight肿瘤170和TruSight UMI工具包检测cfDNA中的低频变异
应用笔记| PDF2 MB
使用TruSight肿瘤UMI试剂检测无细胞DNA中的低频变异
应用笔记| PDF2 MB
数据表| PDF<1 MB
*NovaSeq 6000系统的性能已得到验证，但未进行广泛测试。
