Illumina链mRNA准备
インプット量わずか25 ngの標準(未分解)RNAを利用してコーディングトランスクリプトームを解析できるシンプルで拡張性が高くコスト効率の良い,1日で完了できる迅速ソリューション。阅读更多…
Illumina单链mRNA制备は効率化を実現したRNA序列ソリューションであり、トランスクリプトームを明確かつ網羅的に解析することができます。さまざまなサンプルタイプに柔軟に対応し、トータルRNA25NGという少ないインプット量に対応できます。Illumina单链mRNA制备は、ストランドの向きを精確に測定することができます。また、均一なカバレッジを実現し、未知のアイソフォーム、遺伝子融合、アリル特異的発現といったさまざまな特徴を確実に検出することができます。
Illumina公司滞留mRNA预备は,優れた聚キャプチャー効率とカバレッジ均一性の実現に最適です。コーディングトランスクリプトームを,精確にバイアスなしに検出するために必要なシーケンス深度を最小にできます。Illumina链mRNA准备は、2011年以来9,926報もの文献に引用されているTruSeqライゲーション技術を基にしています。
Illumina公司总RNA链预科は25 ng ~ 1000 ng*の幅広い核糖核酸インプット量に対応します。
ストランドの向きの情報によって,アンチセンス転写産物の検出,転写アノテーションの促進,アライメント効率の向上が可能です。
7時間以内にシーケンス用のライブラリーを調製します。イルミナ認定の自動化オプションは,当社の自動化パートナーを通じてまもなく利用できます。
384年1回のランで最大サンプルをマルチプレックスし,シーケンスできます。(索引设置とBは現在発売中,集CとDは近日発売予定)
RNA-Seqは,ある時点でのトランスクリプトームの詳細なスナップショットが得られるため,第一人者が好んで使用するプラットフォームになりつつあります。定量PCRに勝る以下のような多くの利点を備えています。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 中期输出:5 高输出:16 (基于每个样本25M读取) |
2 × 75 bp |
| NextSeq 2000系统 | P2: 16 P3: 40 (基于每个样本25M读取) |
2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000系统 | SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4:384 (基于每个样本25M读取) |
2 × 75 bp |
| Illumina链mRNA准备 | TruSeq链mRNA | TruSeq RNA库准备工具包v2 | Illumina RNA浓缩Prep | Illumina链总RNA Prep与核糖零度加 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 链特异性 | 被困 | 被困 | 非搁浅 | 非搁浅 | 被困 |
| 技术 | 排序 | 排序 | 排序 | 排序 | 排序 |
| 变异类 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 |
左：Illuminaの性能指標右: Illumina公司滞留mRNA预科をTruSeq滞留mRNAと比較しました。その結果,Illumina公司滞留mRNA预备は,特にインプット量25 ngの表RNAでより優れた性能を示しました。ライブラリーを30米リードにサブサンプリングし,BaseSpace RNA-Seq对齐应用v2.0.1で解析しました。复制は4 mのペアエンドリードパスフィルター(PF)にサブサンプリングしたときのものです。
Illumina公司滞留mRNA预备は,少ないRNAインプット量で,TruSeq滞留mRNAよりも多くの遺伝子を検出することができました。検出遺伝子数は30 mのペアエンドリードPFにサブサンプリングしたときのものです。Illumina链mRNA准备は、1×のカバレッジでより多くの遺伝子を検出したことから、より高い感度を有すると言えます。
Illumina公司滞留mRNA预科では,TruSeq滞留mRNAとの一致率の高いデータが得られます(答:表RNAインプット量は両製品とも同じで100 ng, B:表RNAインプット量はIllumina公司滞留mRNA预科のほうが25 ngと少なく,TruSeq滞留mRNAは100 ng)。
Illumina公司滞留mRNA预科は25 ngの表RNAのテクニカルレプリケート間(A)でも,また表RNAインプット量25 ngと100 ngとの間(B)でも,高いデータ一致率を示しました。ライブラリーを74 bp×2でシーケンスし,30米リードにサブサンプリングしました。データ解析にはBaseSpace RNA-Seq对齐应用v2.0.1を使用しました。
Illumina公司滞留mRNA预科は迅速ワークフローで,ハンズオンタイムを短縮できます。ハンズオンタイムは,使用する装置,処理サンプル数,自動化手順,ユーザーの経験値によって異なります。
数据表| PDF6版本
Illumina链mRNA和总RNA工作流程读取修剪的最佳实践
技术说明| PDF< 1mb
申请须知| PDF<1 MB
小册子| PDF1 MB
小册子| PDF2 MB
コーディングおよびノンコーディングトランスクリプトーム研究用の広範な種類のサンプルから迅速にライブラリーを調製して,他に類を見ない柔軟性を持って研究を行うことができます。