より柔軟にライブラリー調製用の単一コンポーネントを注文していただけるよう,イルミナはモジュール構成品に移行してします。これまでのTruSeq Nano DNA库准备工具包(カタログ番号fc - 121 - 4001, fc - 121 - 4002, fc - 121 - 4003)はTruSeq DNA纳米(カタログ番号20015964(24サンプル),カタログ番号20015965(サンプル数96))に移行します。インデックスアダプターはTruSeq DNA单一索引(カタログ番号20015960(设置),カタログ番号20015961 (B))およびTruSeq DNA CD(デュアルの組み合わせ)索引(カタログ番号20015949)として別売されます。
TruSeq-DNA纳米は利用量の限られた脱氧核糖核酸サンプルでも効率良く実験を行えます。機械的断片化–ライゲーションケミストリーに基づいた、この低インプット量サンプル用の方法により、高品質カバレッジが達成され、ほぼすべてのシーケンスアプリケーションでバイアスが低下します。
ゲルによるサイズ選択をビーズによる選択に変更することで、TruSeq-DNA纳米の効率が高まり、高品質ライブラリーを1.日で調製することが可能になりました。2×101 bp~2×151 bpというさまざまなリード長で最適化されています。
TruSeq DNA纳米では,わずか100 ngのDNAから優れた結果が得られるため,一般的に必要とされるマイクログラムレベルのDNAが不要になりました。この結果,DNA量の限られたサンプル(腫瘍サンプルなど)の解析が可能になり,将来の研究や別の研究で使用するためのサンプルを保存することが可能になりました。ワークフローの加速化に加え,ビーズによるサイズ選択ではゲルを用いた選択の際に一般的にみられるサンプルの損失が回避されます。
TruSeq DNA纳米では,カバレッジ内で一般的なPCRによるギャップの数と平均サイズが低減します。ワークフローが強化されたことにより,ゲノム全体でライブラリーバイアスが低減し,カバレッジ均一性が向上しています。さらにこれらのキットでは,これまでは解析が困難であったGCリッチ領域,プロモーター領域,およびリピート領域などのゲノムコンテンツにおいても優れたカバレッジを実現しています。その結果,各シーケンスランからより多くの情報が得られるようになります。Truseq DNA纳米製品は,ほぼあらゆる次世代シーケンサーアプリケーションで高品質ゲノムカバレッジを達成できることが検証されています。
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*96个UD索引はまもなく利用可能となります。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
---|---|---|
NextSeq 550系统 | 每次运行1个样本(基于30×人类基因组的覆盖范围) | 350 bp插入:≤ 2×100bp 550 bp插入:≤ 2×150bp |
HiSeq 2500系统 | 每次运行2-10个样品(双流槽;基于30倍人类基因组的覆盖范围) | 快速运行,350bp插入:≤2 × 100bp 快速运行,550 bp插入:≤2 × 250 bp 高输出,350 bp插入:≤ 2×100bp 高输出,550 bp插入:≤ 2×125 bp |
规格 | TruSeq-DNA纳米 | TruSeq-DNA无PCR |
---|---|---|
设备类型 | TruSeq DNA Nano LT & HT | TruSeq DNA PCR-Free LT & HT |
描述 | 基于广泛采用的TruSeq库prep,降低了输入,提高了数据质量 | 从根本上减少文库偏见和差距的优良基因组覆盖 |
工作流 | LT工具包:手动工作流程 HT套件:自动化友好型;还提供手动协议 |
LT工具包:手动工作流程 HT套件:自动化友好型;还提供手动协议 |
投入量 | 100-200纳克 |
1-2μg |
包括聚合酶链反应 | 是的 | 没有 |
试验时间 | 5.5小时 | 约5小时 |
实践时间 | 4个小时 | ~ 4个小时 |
插入目标大小 | 350个基点或550个基点 | 350个基点或550个基点 |
无凝胶 | 是的 | 是的 |
支持的样本数量 | 24 (LT)或96 (HT)样品 | 24 (LT)或96 (HT)样品 |
尺寸选择珠子 | 包括 | 包括 |
应用 | 全基因组测序应用,包括全基因组重测序,从头组装和宏基因组学研究 | |
样品多路复用 | 多达24个单、96个组合(CD)双、24个唯一双和96个唯一双(UD)组合 | |
兼容Illumina测序器 | MiniSeq, MiSeq, NextSeq, HiSeq, NovaSeq, HiSeq X, hisansq,以及基因组分析系统 |