什么是核糖体分析?
核糖体谱分析是一种基于核糖体保护mRNA片段深度测序的方法。核糖体分析，也被称为核糖序列(Ribo-Seq)或活性mRNA翻译序列(ART-Seq)，提供了一个特定时间点细胞中所有活性核糖体的“快照”。这些信息可以帮助研究人员确定哪些蛋白质正在细胞中被积极翻译。
核糖体谱分析能够系统监测细胞翻译过程和预测蛋白质丰度。确定被翻译的信息区域有助于确定复杂生物的蛋白质组。与大规模并行高通量下一代测序(NGS)相结合，使用Ribo-Seq进行核糖体分析可以实现详细和准确在活的有机体内蛋白质生产分析。
核糖体分析的优点
通过鉴定进行活性翻译的转录本，Ribo-Seq可以提供对基因调控的一个重要方面的能见度。
- 研究翻译控制和测量基因表达
- 确定翻译起始站点
- 确定蛋白质合成的速率
- 预测蛋白质的丰度
为核糖体分析生成测序库
用Ribo-Seq分析核糖体使用尺寸排除色谱。这种方法简化了将核糖体保护的RNA片段转化为与Illumina仪器测序兼容的文库的步骤。这是一种简单、快速、可扩展的方法，不需要特殊设备。相比之下，其他分离多体和单体的方法依赖于使用蔗糖梯度或缓冲液进行数小时的超离心法。
核糖体分析协议
TruSeq Ribo Profile(以前称为ART-Seq)试剂盒已停产，其基于以下已发表的核糖体分析协议。本出版物提供了分析所需试剂的详细信息，以及在哪里可以购买这些试剂，作为TruSeq Ribo Profile的可能替代品。
Ingolia NT, Brar GA, Rouskin S, McGeachy AM, Weissman JS。用于监测翻译的核糖体分析策略在活的有机体内通过对核糖体保护的mRNA片段进行深度测序。Nat Protoc。2012; 7(8), 1534 - 1550。
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TruSeq Ribo Profile套件已经停产
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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版