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ターゲットRNAシーケンス

ターゲット核糖核酸シーケンス入門

ターゲットRNAシーケンス(RNA-Seq)は特定の目的転写産物を選択してシーケンスする高精度な手法です。定量的情報および定性的情報の両方が得られます。ターゲットRNA-Seqは、濃縮アプローチまたはアンプリコンベースのアプローチで実現できます。このいずれのアプローチでも、フォーカスした一連の目的遺伝子における遺伝子発現解析が可能です。濃縮アッセイでは、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織も含めたさまざまな種類のサンプルにおいて、既知および新規の遺伝子融合パートナーを検出することも可能です。

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ターゲット濃縮RNA-Seqの利点

RNA濃縮により,発現に関する定量的情報が得られ,さらに小さなバリアントや遺伝子融合を検出することができます。RNA濃縮には以下の特長があります:

  • FFPE組織などの難しいサンプルに対応
  • 少ないインプット量(トータルRNAで10 ng, FFPE RNAで20 ~ 100 ng)
  • 既知および新規の融合遺伝子パートナーの両方を検出可能
  • 幅広いダイナミックレンジの遺伝子発現プロファイリングが可能

ターゲットアンプリコンRNA序列の利点

核糖核酸発現パネルは、目的の核糖核酸配列にフォーカスして設計することも、完全最適化され実験で検証されたパネルにカスタムコンテンツを追加することもできます。

  • 目的の転写産物を測定するための精度と特異性の高い手法を実現
  • 発現差解析,アリル特異的発現の測定,および遺伝子融合の検証のための定性的・定量的情報を提供
  • 数十から数千に及ぶターゲットを同時に測定可能
  • 低品質核糖核酸サンプルやFFPE由来の核糖核酸サンプルに対応
小児白血病におけるがんパスウェイの新たな見解

研究者たちは小児白血病における融合遺伝子の役割を理解するためにTruSight RNA泛癌小组を使っています。

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RNA测序文库准备

RNA测序文库

我们针对靶向RNA测序的RNA Seq文库准备解决方案包括非常快速、基于标记的工作流程,用于深入了解许多感兴趣的转录本,包括RNA外显子组。

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RNAシーケンス検討事項

遺伝子発現プロファイリング、ターゲット核糖核酸発現、小核糖核酸解析、など、それぞれのRNA序列実験によって、必要とされるリード長や深度は異なります。このページでは、実験において考慮すべき点をレビューしています。実験計画にご活用ください。

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RNAシーケンス検討事項

ターゲットRNAシーケンスと統合失調症

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ターゲットRNA-Seqワークフロー

イルミナの合成测序(SBS)ケミストリーは最も広く採用されているNGSテクノロジーであり、世界中のシーケンスデータの約90%以上がこのテクノロジーを利用して産生されています。

ライブラリー調製からデータ解析および生物学的解釈までのプロセス全体を簡素化する統合されたターゲットRNA-Seqワークフローを提供します。

基因面板和阵列探测器

プロジェクトに適したシーケンスパネルまたはマイクロアレイを使用してさらに研究を進めてください。

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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版