TruSight RNA泛癌小组

TruSight RNA Pan-Cancer面板はがんトランスクリプトームの包括的な解析が可能です。この製品は以下を特長としています:

• 遺伝子発現情報,バリアントコール,既知および新規の遺伝子融合因子との融合検出
• FFPEサンプルなどのさまざまなタイプのサンプルに対応して少ないインプット量で行える、最適なプロトコール
• がんのパスウェイの全体像を把握
• デスクトップ型シーケンサーで実施される経済的なRNAシーケンス(RNA-Seq)

高精度で経済的なターゲットシーケンス

TruSight RNA Pan-Cancer面板では,遺伝子発現を定量的に測定することだけでなく,既知および新規の遺伝子融合因子からの遺伝子融合を検出することもできます。このパネルは,わずか10 ngの总RNAのインプット量(FFPEサンプルの場合は20 ng)に対応しています。関連遺伝子のサブセットにフォーカスすることにより,高精度なRNA-Seqがデスクトップ型シーケンサーにおいてランあたり8サンプルで行うことができるため,あらゆるラボで挥动をコスト効率よく利用することができます。

直感的に利用できるクラウドベースのデータ解析

解析はRNA序列比对BaseSpaceアプリを使って行うことができます。この直感的なツールは,融合コールと変異検出を行い,遺伝子発現プロファイルを捉えることができるため,あらゆるがん研究に役立つ包括的なソリューションとなっています。

TruSight RNA泛癌サンプルデータセット

MiSeqデータ

ヒトリファレンスRNA(表)10 ng,ヒトリファレンス脳RNA(脳)10 ng,細胞株RNA (MCF7) 10 ng,および乳がんFFPE RNA (BT) 20毫克をTruSight RNA Pan-Cancer面板を用いて調製し,MiSeqシステムでシーケンスしました。リードのマッピングおよび融合コールはBaseSpace序列中心においてRNA-Seq对齐アプリと星对准器を併用して実施しました。

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MiniSeqデータ

ヒトリファレンスRNA (HBRRおよびUHRR),細胞株RNA (MCF7)および乳がんRNAのサンプルをTruSight RNA Pan-Cancer面板を用いて調製し,8サンプルをMiniSeqシステムにおいてシングルインデックスによりリード長2 x76bpでシーケンスしました。全収量は,Q30以上の塩基の96.8%が含まれた4.2 Gbでした。

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