环境宏基因组学是在分析环境样本DNA的基础上研究微生物群落中的有机体。
这方面的例子包括从深海喷口采集的水样或从活动的矿产等人造环境中采集的土壤样本中提取微生物种群。环境宏基因组学研究数据用于农业微生物组分析、生态修复或其他生物学调查。
在下一代测序(NGS)出现之前,环境宏基因组学作为一个领域是极其有限的。NGS为研究人员提供了从复杂样本中描绘整个微生物群落的能力,发现新的生物体,并探索在不断变化的条件下微生物种群的动态性质。
用于环境宏基因组研究的常用NGS方法包括:
环境DNA测序是一种新兴的研究生物多样性和监测生态系统变化的方法。对于某些类型的样本,结合使用环境DNA测序方法可以帮助揭示生态样本的全部多样性,包括细菌和真核物种。
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