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值得咆哮的东西

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现在已经过去两年了Illumina获得了Edico基因组以及DRAGEN技术。我们的愿景是将测序数据的获取和分析简化为一个按钮式的流程化流程,这是非常令人兴奋的,这要感谢DRAGEN。上周五,我们庆祝了我们的第二个周年纪念日,我想回顾一下我们的增长,并分享我们是如何让研究人员提出新的问题,并通过扩大投资组合收集更多有价值的数据。

目前,DRAGEN已与Illumina的测序器、图书馆准备包及其综合软件套件完全集成,使研究人员更容易实施和扩大工作流程。我们很自豪与Broad合作开发了一个统一的DRAGEN-GATK管道,用于短读变体的呼叫,并使其可用于社区。我们还使DRAGEN能够满足人口规模的需求,发布了超快的人口规模队列分析,速度提高了50倍。重要的是,DRAGEN已经成为Illumina产品开发的核心组件,转化为与Illumina上游软件和库准备套件相匹配的优化的新功能和管道。我们还在BaseSpace Sequence Hub上集成了完整的DRAGEN pipeline套件,使研究人员能够通过DRAGEN无缝地将数据流传输到云端,以较低的成本进行按钮分析。通过使DRAGEN可访问,我们看到这个平台被迅速采用,到目前为止,今年已经处理了超过100,000个完整的基因组当量。

也许过去两年最令人兴奋的进展之一是DRAGEN在新nexttseq 2000系统上的集成,允许高效、准确的分析,现在全部与测序结合在一起。但这并不意味着我们要停止甚至减速。作为创新者,我们的工作仍在继续。我们的开发团队正在夜以继日地工作(这些天主要在家里),为我们的客户提供更加精简和集成的样本回答体验。

最后,当冠状病毒大流行席卷全球时,我们认真、快速地审视了如何在最前线发挥最大能力抗击病毒。很快,我们就能够开发并发布Illumina SARS-CoV-2数据工具包这是一套新的数据分析工具和工作流程功能,供使用下一代测序(NGS)的人员使用,全球研究界可免费使用。重要的是,该工具包利用DRAGEN的速度和准确性来加速传染病监测和疫情应对,包括一个新的DRAGEN RNA病原体检测管道,以及一个用于疫情监测的DRAGEN宏基因组学管道。

我要感谢我的团队、我们的客户、合作伙伴和合作者,感谢他们为DRAGEN的成长和进步做出的贡献。这是DRAGEN在Illumina的伟大的头两年。但尽管我很喜欢回顾我们所取得的成就;我更喜欢我们未来的样子。有关我们DRAGEN进展和管道的更多信息,请访问我们的新闻中心