Illumina综合癌症小组的AmpliSeq为分析409个已知与癌症相关的体细胞突变提供了一个靶向的重测序解决方案。主要特点包括:
综合癌症小组是综合工作流程的一部分,包括基于PCR的文库制备的AmpliSeq, Illumina合成测序(SBS)下一代测序(NGS)技术,以及自动化分析。
该小组检测多种癌症类型的变异,包括肺癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、黑色素瘤和前列腺恶性肿瘤。该面板为您节省了识别目标、设计引物和优化面板的时间和精力。
仪器 | 推荐样本数量 | 读取长度 |
---|---|---|
NextSeq 550系统 | 每次采样:中等输出4个,高输出12个(假设最小覆盖面积为500×) | 2 × 150bp |
Illumina综合癌症小组的AmpliSeq | Illumina Cancer Hotspot Panel v2的AmpliSeq | |
---|---|---|
试验时间 | 6小时(仅在图书馆准备;不包括库量化、规范化或池化时间) | 5小时(图书馆准备;不包括库量化、规范化或池化时间) |
癌症类型 | Pan-Cancer,固体肿瘤 | Pan-Cancer,固体肿瘤 |
内容规范 | 409个癌症相关基因的全外显子覆盖。 | 已知与癌症相关的50个基因的热点区域 |
描述 | 泛癌基因的躯体分析研究。 | 50个癌症相关基因热点区域的躯体分析研究。 |
实践时间 | < 1.5小时 | < 1.5小时 |
输入数量 | 1 - 100ng(建议每个池10ng) | 1 - 100ng(建议每个池10ng) |
方法 | 扩增子测序,有针对性的DNA测序 | 扩增子测序,有针对性的DNA测序 |
多路复用 | 96对偶指数组合 | 96对偶指数组合 |
专门的样本类型 | 血,FFPE组织 | FFPE组织 |
物种分类 | 人类 | 人类 |
应用说明| HTML
Illumina样品识别面板使用AmpliSeq进行样品识别
应用说明| HTML
数据表| HTML
product_file | EXCEL< 1mb
应用笔记| PDF< 1mb