测量基因和转录本的丰度;检测编码和非编码RNA中的已知和新特征。靶向杂交去除大量的rRNA,以关注转录组的高价值部分。
量化基因表达,识别编码转录组中已知的和新的异构体,检测基因融合,并测量等位基因特异性表达。
分析一组有重点的感兴趣基因的基因表达。提供定量表达信息以及小变异和基因融合的检测。
利用超深度测序聚合酶链反应(PCR)扩增子分析感兴趣的RNA序列、差异表达分析、等位基因特异性表达测量和基因融合验证。
应用程序 | 产品 | 好处 |
---|---|---|
总RNA序列 | Illumina总RNA链预备 |
|
信使rna序列 | Illumina链mRNA预备 |
|
有针对性的RNA序列 | Illumina RNA富集预处理 |
|
应用程序 | 全转录组 | 信使核糖核酸 | RNA浓缩 |
---|---|---|---|
实践时间 | < 3小时 | < 3小时 | < 2小时 |
周转时间 | ~ 7小时 | 6.5小时 | < 9小时 |
输入 | 1 - 1000ng标准质量RNA;10ng的最佳性能和FFPE样品 | 25 - 1000ng标准质量RNA | 10 ng标准质量RNA;20ng RNA用于低质量/降解/ FFPE |
自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
PCR协议 | 没有 | 没有 | 是的 |
图书馆需要定量? | 是的 | 是的 | 是的 |
包括碎片? | 是的 | 是的 | 不是必需的 |
产品 | Illumina总RNA链预备 | Illumina链mRNA预备 | Illumina RNA富集预处理 |
这三种试剂盒允许您通过在单个NovaSeq S4 Flow Cell上装载多达384个样品来降低测序成本,使用384个独特的双指标来实现更高的通量测序。
珠链转座子标记是一种创新技术,使用在我们的图书馆准备作品集。通过同时切割gDNA和添加Illumina测序引物,珠上标记可以让你比以前更快地获得序列就绪文库。在没有辅助试剂或设备的情况下,将你的库进行规范化。减少周转时间和复杂性。
亚博官网人口在我们的NGS库准备中使用的另一项关键技术是适配器连接,它以一致的、高质量的数据而闻名。文库的制备方法是将一个gDNA或cDNA样本进行片段化,并将特殊的适配器连接到两个片段的两端。这些适配器包含全部的测序引物杂交位点。这消除了额外PCR步骤的需要,使过程完全自动化。
亚博官网人口我们会考虑您的需求,并提出建议。
两种流行的RNA文库准备包之间的关键比较揭示了对进行RNA测序研究的研究者感兴趣的新信息。
一套全面的NGS分析方法:
这篇文章收集了各种用于RNA测序的NGS方法,从科学文献中汇编,包括正反两方面,出版摘要和参考文献。
增加每次运行的测序样本数量,并使用唯一的双索引适配器优化高通量测序。
独特的分子标识(UMIs)提供了错误校正和准确性,并可以减少假阳性的变异呼叫,同时增加变异检测的敏感性。
我们的合作伙伴开发了高吞吐量和低吞吐量的自动化方法,涵盖了我们的图书馆准备工作。
在单一检测中检测已知的和新的特征,包括转录物的异构体,基因融合,和单核苷酸变异,所有这些都没有事先的知识。