Illumina COVIDSeq测试是首个根据美国食品和药物管理局紧急使用授权(EUA)批准使用的NGS测试。这种基于扩增子的NGS检测包括2019-nCoV引物和探针装置,用于检测疑似COVID-19感染症状和体征的患者鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子中SARS-CoV-2病毒的RNA。
Illumina COVIDSeq测试可以放大或缩小,以适应不同数量的样本。在NovaSeq 6000系统上,使用两个NovaSeq 6000 S4试剂包和Xp工作流程,最多可在12小时内处理3072个结果。
该工作流程包括病毒RNA提取、RNA到cdna转换、PCR、文库制备、测序、分析和报告生成等步骤。关键组件包括高通量NovaSeq 6000系统、Illumina COVIDSeq测试和DRAGEN COVIDSeq测试管道,用于快速临床结果报告。
Illumina-COVIDSeq试验利用经验证的、公开可用的ARTIC多重PCR协议的改进版本,98个扩增子设计用于扩增SARS-CoV-2病毒特异性序列,并结合经验证的Illumina测序技术。作为一项质量特征,每个样本中都包含由11个人类mRNA靶点组成的内部控制,以监测错误。
Illumina COVIDSeq Test是一款新一代测序(NGS)产品。在体外用于从鼻咽部(NP)拭子、口咽部(OP)拭子、前鼻拭子、中鼻甲鼻拭子、鼻咽部洗液/吸液、鼻吸液、以及医疗服务提供者对疑似COVID-19患者的支气管肺泡灌洗(BAL)标本。检测仅限于根据1988年临床实验室改进修正案(CLIA), 42 U.S.C.§263a认证的实验室,用于执行高复杂性的检测。结果用于SARS-CoV-2 RNA的鉴定。SARS-CoV-2 RNA通常可在感染急性期的呼吸道标本中检测到。
阳性结果表明存在SARS-CoV-2 RNA;确定患者感染状况需要与患者病史和其他诊断信息的临床相关性。阳性结果不排除细菌感染或与其他病毒合并感染。美国及其领土内的实验室必须向有关卫生当局报告所有阳性结果。
阴性结果并不排除SARS-CoV-2感染,也不应作为患者管理决策的唯一依据。阴性结果必须与临床观察、患者病史和流行病学信息相结合。
Illumina-COVIDSeq测试旨在供经过专门培训的合格和受过培训的临床实验室人员使用,这些人员专门接受过Illumina NovaSeq 6000测序系统和下一代测序工作流程的使用培训,以及在体外诊断程序。COVIDSeq尚未获得FDA批准或批准。该测试是FDA在EUA下授权的,在声明存在的情况下授权紧急使用体外诊断用于COVID-19的检测和/或诊断。亚博下载app
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