Illumina公司COVIDSeq测试

这种高通量下一代测序(NGS)检测从疑似COVID-19患者的鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子中检测SARS-CoV-2。阅读更多…

主要特点和好处
  • 准确性:检测98个SARS-CoV-2目标,实现高精度检测
  • 吞吐量:使用NovaSeq 6000系统12小时即可获得3072个结果
  • 质量控制:内部控制包括每个反应中的11个人类mRNA靶点。

製品のハイライト

Illumina COVIDSeq测试是首个根据美国食品和药物管理局紧急使用授权(EUA)批准使用的NGS测试。这种基于扩增子的NGS检测包括2019-nCoV引物和探针装置,用于检测疑似COVID-19感染症状和体征的患者鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子中SARS-CoV-2病毒的RNA。

快速、可扩展的SARS-CoV-2检测

Illumina COVIDSeq测试可以放大或缩小,以适应不同数量的样本。在NovaSeq 6000系统上,使用两个NovaSeq 6000 S4试剂包和Xp工作流程,最多可在12小时内处理3072个结果。

工作流和组件

该工作流程包括病毒RNA提取、RNA到cdna转换、PCR、文库制备、测序、分析和报告生成等步骤。关键组件包括高通量NovaSeq 6000系统、Illumina COVIDSeq测试和DRAGEN COVIDSeq测试管道,用于快速临床结果报告。

设计及品质控制

Illumina-COVIDSeq试验利用经验证的、公开可用的ARTIC多重PCR协议的改进版本,98个扩增子设计用于扩增SARS-CoV-2病毒特异性序列,并结合经验证的Illumina测序技术。作为一项质量特征,每个样本中都包含由11个人类mRNA靶点组成的内部控制,以监测错误。

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仕様

预期用途

Illumina COVIDSeq Test是一款新一代测序(NGS)产品。在体外用于从鼻咽部(NP)拭子、口咽部(OP)拭子、前鼻拭子、中鼻甲鼻拭子、鼻咽部洗液/吸液、鼻吸液、以及医疗服务提供者对疑似COVID-19患者的支气管肺泡灌洗(BAL)标本。检测仅限于根据1988年临床实验室改进修正案(CLIA), 42 U.S.C.§263a认证的实验室,用于执行高复杂性的检测。结果用于SARS-CoV-2 RNA的鉴定。SARS-CoV-2 RNA通常可在感染急性期的呼吸道标本中检测到。

阳性结果表明存在SARS-CoV-2 RNA;确定患者感染状况需要与患者病史和其他诊断信息的临床相关性。阳性结果不排除细菌感染或与其他病毒合并感染。美国及其领土内的实验室必须向有关卫生当局报告所有阳性结果。

阴性结果并不排除SARS-CoV-2感染,也不应作为患者管理决策的唯一依据。阴性结果必须与临床观察、患者病史和流行病学信息相结合。

Illumina-COVIDSeq测试旨在供经过专门培训的合格和受过培训的临床实验室人员使用,这些人员专门接受过Illumina NovaSeq 6000测序系统和下一代测序工作流程的使用培训,以及在体外诊断程序。COVIDSeq尚未获得FDA批准或批准。该测试是FDA在EUA下授权的,在声明存在的情况下授权紧急使用体外诊断用于COVID-19的检测和/或诊断。亚博下载app

请联系Illumina代表了解区域可用性。

高层工作流

常见问题

关于covid - seq测试

该试验已获得FDA紧急使用授权(EUA),可作为检测和/或诊断COVID-19的体外诊断试验。

不,这种检测只检测导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒。

本试验利用放大子方法对SARS-CoV-2进行靶基因重新测序。有关工作流说明和其他详细信息,请参阅使用说明文档。

紧急使用授权授权FDA在宣布的紧急状态下促进未经批准的产品的供应,或未经批准的产品的使用。当紧急状态结束时,该试验不再被授权用于临床,并默认为标准监管要求。

该测试可供数量有限的早期访问客户使用,这些客户具有高样本量测序经验并满足工作流程要求,包括完全配备NovaSeq 6000系统、DRAGEN和PCR设备。测试仅限于根据1988年《临床实验室改进修正案》(CLIA)42 U.S.C.§263a认证的实验室,以执行高复杂性测试。

必须进行更多的检测,以控制全球大流行,并恢复工作、学校和正常活动。然而,COVID-19检测相关产品严重短缺,许多临床实验室面临能力和资源限制。covid - seq利用高度可扩展和准确的测序技术,使实验室能够加强和多样化检测,有助于提高COVID-19的检测能力。

本产品在CE-IVD监管的欧洲国家仅用于性能评估(PEO),或在其他非美国国家作为研究用途(RUO)。国家。根据地区和国家的不同,可能需要额外的数据才能将covid - seq用作诊断测试。

COVIDSeq工作流

此检测仅被授权与NovaSeq 6000 S4试剂试剂盒(Xp工作流程)一起使用。使用其他NovaSeq 6000试剂包或Illumina其他测序系统需要独立的验证和单独的紧急使用授权。

本试验授权用于鼻咽(NP)、口咽(OP)和中鼻甲(MT)鼻拭子。

在NovaSeq S4流动单元上,每个道最多可以装载384个样品,每个流动单元总共可以装载1536个样品。2个流动槽可以同时运行,每次运行共3072个样品。

Illumina提供多达384个UD索引(IDT for Illumina Nextera DNA Unique Dual indexes Sets A-D)。

分析和报告

该测试使用Illumina DRAGEN COVIDSeq测试管道。

对冠状病毒-19的阳性检测结果表明,检测到来自SARS-CoV-2的RNA,患者感染了该病毒,并被认为具有传染性。在做出最终诊断和患者管理决策时,应始终结合临床观察和流行病学数据考虑实验室检测结果。患者管理应遵循当前的CDC指南。

本试验的阴性试验结果意味着样本中不存在高于检测限的SARS-CoV-2 RNA。然而,阴性结果并不排除新冠病毒-19,也不应作为治疗或患者管理决策的唯一依据。阴性结果并不排除新冠病毒-19的可能性。

COVIDSeq使用说明

本文档描述了从样品采集到数据分析和报告生成的工作流程,并列出了所需的材料和设备。

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