博德研究所和Illumina公司已经开始合作,共同开发和改进基因组分析管道,首先将Illumina公司的DRAGEN(基因组动态读分析)硬件加速信息学平台的方法集成到博德研究所的GATK(基因组分析工具包)最佳实践小变量管道中。由此产生了DRAGEN-GATK最佳实践。
在这个网络研讨会,布罗德研究所的埃里克·班克斯说将描述开发团队在研究DRAGEN和GATK工具之间的差异时遇到的一些问题,并重点介绍在新的最佳实践管道中实施的方法的改进。
他还将解释团队如何评估管道的开源版本和许可(硬件加速)版本之间的功能等效性,展示在相同源输入的两种方法之间的结果。
演讲者:
Eric银行,博士。
计算生物学家,数据科学平台高级主任,研究所科学家
Broad研究所
Severine Catreux博士
生物信息学主任
Illumina公司