Illumina SARS-CoV-2 NGS数据工具包利用DRAGEN的速度和准确性,加快传染病监测和疫情应对。该工具包包括用于识别新型传染病病原体的DRAGEN宏基因组管道,用于检测病毒病原体的DRAGEN RNA病原体管道,以及用于检测SARS-CoV-2突变的DRAGEN Lineage应用程序。可以通过BaseSpace Sequence Hub访问DRAGEN冠状病毒工具。关于德拉肯平台的冠状病毒检测和监测的更多信息可在这篇软件博客文章.
DRAGEN RNA管道的更新版本现在可用于加速病毒病原体的检测。该管道有助于在任何DRAGEN RNA Seq管道运行中检测SARS-CoV-2,无论应用程序如何。该管道包括:
该应用程序将读取数据与SARS-CoV-2参考基因组对齐,并报告目标区域的覆盖范围。它执行:
对于希望生成SARS-CoV-2检测临床报告以诊断有症状患者中的COVID-19的用户,DRAGEN COVIDSeq测试管道与Illumina-COVIDSeq试验。
对于希望为鸟枪宏基因组学生成临床报告的用户,IDbyDNA提供简单、强大的生物信息学软件,将测序器生成的数据转化为可操作的见解。IDbyDNA经验证的自动化解释平台分析支持检测35种呼吸道病毒,包括SARS-CoV-2的基因组特征。请致电833-397-5439或与IDbyDNA客户服务部联系clientservices@idbydna.com要学习yobet亚洲亚博官网人口更多的知识。
Illumina正在为新冠病毒-19研究社区提供一个自由、协作的环境,以更好地了解调节宿主反应的关键因素,并帮助确定潜在治疗的生物标志物。
BaseSpace Correlation Engine如何推进您的研究:
BaseSpace Sequence Hub旨在促进研究小组之间安全、审计控制的协作。数据管理和共享功能(如工作组)允许您与协作者安全地共享项目和运行,而无需下载文件。
Illumina SARS-CoV-2 NGS数据工具包具有以下特点:BaseSpace序列中心应用程序为了合作。这个GISAID提交应用程序接受VCF或FASTA文件的集合,以及相同样本的元数据CSV。该应用程序在将数据提交给GISAID进行进一步QA和处理之前执行数据验证。
下载BaseSpace安全与隐私信息在BaseSpace Sequence Hub上可以获得完整的Illumina SARS-CoV-2 NGS数据工具包。更新后的DRAGEN COVID-19工具也将在DRAGEN服务器上提供,并将通过DRAGEN API提供给开发者
研究人员可以从今天开始在BaseSpace Sequence Hub上免费使用Illumina SARS-CoV-2 NGS数据工具包,直到2021年12月31日。研究人员可以将数据直接从他们的仪器传输到BaseSpace的安全云环境中,以便按按钮使用整个工具包。
yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于BaseSpace的信息DRAGEN API适用于希望在云中实现分析自动化的大型研究中心。该API构建在Amazon Web服务之上。它允许用户调用一个简单的API端点,以流式传输、处理冠状病毒样本数据,并从他们自己的AWS S3存储桶传递数据。
要通过DRAGEN API请求尽早访问新的DRAGEN冠状病毒工具,请填写下表。
BaseSpace Sequence Hub由Amazon Web Services提供支持,允许您通过一组精心策划的分析应用程序轻松管理和分析数据。iCredits是用于购买Illumina基因组数据存储和分析选项的货币。
Illumina DRAGEN Bio IT平台提供精确、超快速的测序数据二次分析。
NextSeq 2000系统支持新兴和中吞吐量测序应用,以及广泛的方法,如外显子组测序、目标富集、单细胞分析、转录组测序等。
DRAGEN富集管道也可用于检测和识别SARS-CoV-2。该管道可以在BaseSpace Sequence Hub上以较低的每样例成本获得,并且可以在DRAGEN服务器上访问。
亚博官网人口*BaseSpace序列中心SARS-CoV-2 NGS数据工具包在2021年12月31日之前是免费的。