イルミナでは,探索/発見から育種における展開/決定までをサポートするアグリゲノム“
100年ジャパンアグリiSeqグラント2018受賞者が決定しました
100年ジャパンアグリiSeqグラント2018は，日本の農学研究にISEQ 100システムををいただいごプログラムですからましのましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましましまし
精选かつかつ迅速，复雑なゲノムのアセンブリーを成
植物や魚類のゲノム配列を新创アセンブリーによって決定するには,倍数性やリピート配列などの問題により長い時間と多大な労力が必要です。イルミナは,ショートリードデータを補うため,メイトペアシーケンスおよびロングリードテクノロジーを提供しています。これらの組み合わせにより,様々な生物種において迅速な高品質ゲノムのアセンブリーに貢献します。
メイトペアシーケンス
メイトペア法は，de novoシーケンスおよび构造変を可能にする，インサートサイズののライブラリー调制ですですというインサートを持つラリーの両端をするするによりラリーのをするするによりによりによりによりベース离れ200
合成ロングリードシーケンス
イルミナは2016年，nrgene，10x基因组学，燕尾术基因组学という3つの会とのコマーケティングゲノムを発表発表ましたたゲノム构造研重要たとなる配列情で重要重要情情，イルミナイルミナ高精度短读から再构筑するの技术により，复雑なゲノムを持つ生物种种ゲノム研ますを加入でき。
遺伝的多様性を同定し,形質との関連を特定
生物種のリファレンスゲノムができたら,遺伝子,SNP,構造多型の探索および遺伝型決定には全ゲノムリシーケンスが適したアプローチです。その後,RNAシーケンスによる発現解析と組み合わせたeQTL解析,マイクロアレイによる全ゲノム関連解析などにより。新規に得られた多型情報の形質との関連を特定することが出来ます。
全ゲノムリシーケンス
HiSeqシリーズは,集団規模の全ゲノム解析を低コストで実施できるシステムです。特にHiSeq X 10システムにより,ヒト全ゲノムシーケンスがこれまでにない1000ドルという低価格で実施できるようになりました。2015年,HiSeq Xを用いた全ゲノム解析の適用がヒト以外の生物種にも拡張されました。種の制限なく,ゲノムあたり15 x以上のカバレッジで全ゲノム解析を低コストに実施できます。
RNAシーケンス
リファレンスゲノム情報が整備されていない生物種でも,RNAシーケンスは有効な探索ツールです。トランスクリプトームの比較により,発生や病気,ストレス下の遺伝子発現レベルの変化に新たな知見をもたらします。このアプローチは遺伝子およびタンパク質機能と相互作用を明らかにしたり,組織特異的なRNA転写産物(mRNA,ノンコーディングRNA,低分子RNAなど)およびcSNPを同定したりすることができます。
全ゲノム关键词（GWAS）
全ゲノムにわたり高密度にSNPをカバーしたマイクロアレイを用いて格干を行うことにより,遺伝子型と表現型の関連性を明らかにすることができます。農作物や家畜の改良に重要な特性を持つ個体の同定,また繁殖プランの決定およびゲノミック選抜のための情報を得ることが出来ます。
家畜や作物のゲノム選抜,品種識別や親子判定などジェノタイピングによる検査を実施
特定の価値形質に関連する遺伝マーカーを同定し,望ましい特徴をもつ家畜,作物を同定するための大規模なスクリーニングに活用することができます。
シーケンスによるジェノタイピング
次世代シーケンサーを用いたジェノタイピングは，低コストでフレキシブルにスクリーニング行うアプローチですターゲットリシーケンスではです。ターゲットリシーケンスでは，事前の知见によって得られある定のゲノムをディープシーケンスするが可以でディープことが可以でシーケンサーをを绞るデスクトップデスクトップでももなデータ量
低コスト高スループットな动词用カスタムジェノタイピング
Truseq Genotype Neの详细はこちら»
マイクロアレイによるジェノタイピング
低コストで大規模ジェノタイピングを実現するカスタムマイクロアレイ,英飞纳姆XTでは，短晚期多重体のdnaマーカーセットを调べる必要がます。以外，マイクロアレイをこのなますにと，コストやスループット制にジェノタイプできる의のあり制れるという数ががましとという问题ががありありましといういう问题がましましまし
Infinium XTは，Infiniumアッセイの実积を土台新闻な96サンプルbeadchipををををカスタムマイクロアレイです.1サンプルあたりのです.1サンプルあたりのを抑え，效率に大规模抑えタイピング実施よう最适规模タイピングタイピング実施よう最适ささてて実施よう化れていいいい。产业规模のジェノタイピングプロジェクト，マイクロアレイでパワフルに推进でき。
英飞纳姆XTの特長| コンテンツ | 最大5万SNPを搭載 |  |
| 生物数量 | 异なる生物种种パネルパネルをせることができことができことができことができことができ，幂途へ利用が可用 | |
| 価格 | SNP数、生物種数,サンプル数に応じて決定 |
プロジェクトについて相谈する
※ごご文は10万サンプルサンプルサンプル致し。
ウェビナー录画
ゲノム編集技術の養殖魚育種への応用
ゲノム编集技术の开启により，非モデル生物でもに狙った子を改変するがた农作品なったたが选抜とと畜たは，长·选抜に突然个の·选抜により形质个个·持つ多数の品牌が作用制れてた。一方，养殖鱼では，品牌の作用がほとんどれてい。本ウェビナーではいないであるとにゲノム养殖鱼であるマダイトラフグゲノムゲノムを施すことことトラフグの多种品牌を短で
ショートリードで仕上げる体スケールのゲノムアセンブリ
動植物などある程度大きく複雑なゲノムの新创シークエンスでは,ロングリードを駆使したとしても,繋がった配列の数やサイズが染色体相当にまとまることはほぼあり得ない。近年,クロマチン動態を調べるための方法として以前から使用されていた高cが,染色体スケールのゲノムスキャフォルディングに盛んに利用されるようになってきた。本ウェビナーでは,高cを用いたゲノムスキャフォルディングについて,自身の研究室内でサンプルプレップからスキャフォルディングまでを運用してきた実績に基づいて,丸投げタイプの受託や有償キットを利用した場合と比較しながら,効率的な活用方法を吟味する。
次世代シーケンサーを利用した新技型規術GRAS-Diの開発
“基因分型随机扩增子Sequencing-Direct (GRAS-Di)”は,2回のPCRで作製したアンプリコンを挥动で解析するSNP検出技術です。リファレンス配列を用いたプライマー設計やサイズセレクション,断片化,ノーマライゼーションを必要としない,簡便かつ低コストな技術であり,サトウキビのようなヘテロかつ高次倍数性の生物の解析も可能です。本技術の概要に加え,イネおよびサトウキビでの解析結果について紹介します。
mig-seq法：次世代シーケンサーを用たた手軽ゲノムワイドワイド基配列分享
MIG-seq(多路复用ISSR的基因测序)法は,挥动を利用した手軽なゲノムワイドSNPジェノタイピング技術として開発された。その特徴として,生物種を問わず広く適用が可能で,例えば標準的な解析では,1度に数百サンプルの少量のDNA試料を対象として,迅速(3日)・簡単(2回のPCRと挥动ラン)・経済的(消耗品は~ 1000円/サンプル)に数百座以上のSNP分析ができる。
加加リソース
アグリゲノム論文集“農業におけるゲノム選抜”
ゲノム選抜は,ゲノム中に分布する多数のDNAマーカーを利用して育種価を推定し,有用な個体を選抜する育種方法です。ゲノム選抜に関する用語や概念の解説から,応用までのステップや経済的考察までをまとめた和文レビューが完成しました。家畜,水産物,穀物など,様々な生物種での最新の応用事例をご参照ください。