TruSight癌症
専門家が精選したこのシーケンスパネルでは,さまざまながんの罹患素因と関連付けられている94個の遺伝子と284個のSNPをターゲットとしています。阅读更多…
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過去にがんの素因と関連付けられた遺伝子をターゲットにしています。
TruSight癌症には,一般的ながん(乳がんや大腸がんなど)と稀ながんの両方に関連する遺伝子群が含まれています。さらに,このセットには全ゲノム関連解析(GWAS)によりがんとの関連が確認された284のSNPも含まれています。コンテンツは,科学文献およびその他の高品質の情報源からの専門家のキュレーションに基づき選択されました。
TruSight癌症シーケンスパネルには,選択された目的の領域をターゲットとするカスタムオリゴで構成されています。4回の濃縮反応に必要な量が入っています。TruSight癌症はTruSight快速捕获と併用できます。
TruSight癌症シーケンスパネルを使って6つのヒトリファレンスサンプルを調製しました。得られたライブラリーはMiniSeqシステムで,高出力キットを用い,デュアルインデックスの2 x 100个基点リード長の条件でシーケンスを行いました。トータルデータ量は5.2 Gbで,Q30以上の塩基は全体の95.8%でした。
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| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| MiniSeq系统 | 每次运行的样本:中输出:12，高输出:24(基于每个目标> 20x覆盖率) | 可达2 × 150 bp |
| 米塞克系统 | 每次测试的样品(通过试剂试剂盒版本):v2: 12, v3: 24(基于每个目标的> 20x覆盖率) | 可达2 × 150 bp |
| NextSeq 550系统 | 每次运行的样本数：中输出：96，高输出：96（基于每个目标覆盖率>20倍） | 可达2 × 150 bp |
| TruSight癌症 | Illumina BRCA面板的AmpliSeq | |
|---|---|---|
| 试验时间 | 1.5天 | 5小时(仅限图书馆预科;不包括库量化、规范化或池化时间) |
| 癌症类型 | Pan-Cancer | 实体瘤 |
| 内容规格 | 固定的探针，丰富94个基因和284个SNPs与常见和罕见癌症。 | 基因的外显子区和侧翼内含子序列乳腺癌易感基因1和BRCA2 |
| 描述 | 常见和罕见癌症的种系突变检测研究。 | 种系和体细胞分析研究乳腺癌易感基因1和BRCA2. |
| 准时到达 | 5个小时 | <1.5小时 |
| 输入数量 | 50 ng DNA | 1-100 ng(建议每个池10 ng) |
| 方法 | 目标浓缩，目标浓缩，有针对性的DNA测序 | 扩增子测序,有针对性的DNA测序 |
| 多路复用 | 96 -丛 | 96双指标组合 |
| 专门的样本类型 | 不兼容FFPE | 血液，FFPE组织 |
| 物种分类 | 人类 | 人类 |
| 变异类 | 种系变异体 | 种系变异，插入-缺失(indels)，单核苷酸多态性(SNPs)，体细胞变异 |
product_file | EXCEL< 1 MB
数据表| PDF< 1mb
数据表| PDF2 MB
关于生物标志物专利和产品特定用途的其他专利注意事项:
一些基因组变异，包括一些核酸序列，以及它们在特定应用中的使用可能受到专利保护。建议客户确定，为了在客户的特定应用中使用产品，是否需要从拥有或控制此类专利的一方获得许可。
