TruSight肿瘤学500高通量アッセイはTruSight肿瘤学500アッセイをベースに,サンプルスループットとバッチオプションを向上させる柔軟性を備えています。
複数のバイオマーカーを一つのアッセイに統合
合理化されたサンプルからバリアントコールレポートまでのワークフロー
高いサンプルスループット
高い信頼性の結果を達成
施設内での包括的ゲノムプロファイリングの実現
このファミリーに含まれる3.つのアッセイはすべて、主要ガイドラインや臨床試験に含まれる重要なバイオマーカーを検出するように設計されています。
FFPE検体から関連がんバイオマーカーを解析できます
TruSight肿瘤学500アッセイ同様、組織検体から同じバイオマーカーを検出し、一回192サンプルまで解析できます
血漿検体から血中ctDNAを対象に、TruSight肿瘤学500アッセイの脱氧核糖核酸パネルと同じ遺伝子を解析します
TruSight肿瘤500高通量 | 500年TruSight肿瘤学 | TruSight肿瘤500 ctDNA | |
---|---|---|---|
癌症类型 | Pan-Cancer | Pan-Cancer | Pan-Cancer |
内容规范 | 从523个感兴趣的基因中靶向选择DNA,从55个基因中靶向选择RNA,总共1.94Mb面板大小。 •指南覆盖范围:针对多种实体肿瘤类型的关键指南的广泛覆盖范围 •临床试验覆盖范围:超过1000项临床试验 •免疫肿瘤生物标志物覆盖范围:包括TMB和MSI生物标志物;也包括HLA区域POLE1和POLD1*。 |
从523个感兴趣的基因中靶向选择DNA,从55个基因中靶向选择RNA,总共1.94Mb面板大小。 •指南覆盖范围:针对多种实体肿瘤类型的关键指南的广泛覆盖范围 •临床试验覆盖范围:超过1000项临床试验 •免疫肿瘤生物标志物覆盖范围:包括TMB和MSI生物标志物;也包括HLA区域POLE1和POLD1*。 |
靶向选择523个基因(全编码序列),共1.94Mb面板大小。 •指南覆盖范围:针对多种实体肿瘤类型的关键指南的广泛覆盖范围 •免疫肿瘤生物标志物覆盖范围:TMB和MSI* |
实践时间 | ~ 10.5小时 | 手动:~ 10.5小时 自动化:~ 2.5小时 |
手动:~ 10.5小时 自动化:~ 2.5小时 |
输入数量 | 40 ng DNA, 40-80 ng RNA(需要至少2 mm3.FFPE组织) | 40 ng DNA, 40 ng RNA | 30 ng cfDNA (8-10 ml血浆) |
方法 | 目标浓缩,目标浓缩,有针对性的DNA测序,有针对性的RNA序列 | 目标浓缩,目标浓缩,有针对性的DNA测序,有针对性的RNA序列 | 目标浓缩,目标浓缩,有针对性的DNA测序 |
核酸类型 | DNA, RNA | DNA, RNA | 脱氧核糖核酸 |
样本吞吐量 | 每个流池16-192个样品 | ||
专门的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | 血液,无细胞DNA,循环肿瘤DNA |
物种分类 | 人类 | 人类 | 人类 |
系统兼容性 | NovaSeq 6000 | NextSeq 500,NextSeq 550,研究模式下的NextSeq 550Dx | NovaSeq 6000 |
技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
变异类 | 拷贝数变异(CNVs),基因融合,插入-缺失(indels),转录本变异 | 拷贝数变异(CNVs),基因融合,插入-缺失(indels),转录本变异 | 拷贝数变异(CNVs),基因融合,插入-缺失(indels),体细胞变异 |
カスタムプロトコルセレクタ
生成自定义的端到端指令
*基于PierianDx临床知识库,截至2020年3月