TruSight肿瘤500高通量
FFPEサンプルから,一回192サンプルまで解析できるゲノムプロファイリングアッセイです。阅读更多…
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TruSight肿瘤学500高通量アッセイはTruSight肿瘤学500アッセイをベースに,サンプルスループットとバッチオプションを向上させる柔軟性を備えています。
複数のバイオマーカーを一つのアッセイに統合
合理化されたサンプルからバリアントコールレポートまでのワークフロー
高いサンプルスループット
高い信頼性の結果を達成
施設内での包括的ゲノムプロファイリングの実現
このファミリーに含まれる3.つのアッセイはすべて、主要ガイドラインや臨床試験に含まれる重要なバイオマーカーを検出するように設計されています。
FFPE検体から関連がんバイオマーカーを解析できます
TruSight肿瘤学500アッセイ同様、組織検体から同じバイオマーカーを検出し、一回192サンプルまで解析できます
血漿検体から血中ctDNAを対象に、TruSight肿瘤学500アッセイの脱氧核糖核酸パネルと同じ遺伝子を解析します
| TruSight肿瘤500高通量 | 500年TruSight肿瘤学 | TruSight肿瘤500 ctDNA | |
|---|---|---|---|
| 癌症类型 | Pan-Cancer | Pan-Cancer | Pan-Cancer |
| 内容规范 | 从523个感兴趣的基因中靶向选择DNA，从55个基因中靶向选择RNA，总共1.94Mb面板大小。 •指南覆盖范围:针对多种实体肿瘤类型的关键指南的广泛覆盖范围 •临床试验覆盖范围：超过1000项临床试验 •免疫肿瘤生物标志物覆盖范围:包括TMB和MSI生物标志物;也包括HLA区域POLE1和POLD1*。 |
从523个感兴趣的基因中靶向选择DNA，从55个基因中靶向选择RNA，总共1.94Mb面板大小。 •指南覆盖范围:针对多种实体肿瘤类型的关键指南的广泛覆盖范围 •临床试验覆盖范围：超过1000项临床试验 •免疫肿瘤生物标志物覆盖范围:包括TMB和MSI生物标志物;也包括HLA区域POLE1和POLD1*。 |
靶向选择523个基因(全编码序列)，共1.94Mb面板大小。 •指南覆盖范围:针对多种实体肿瘤类型的关键指南的广泛覆盖范围 •免疫肿瘤生物标志物覆盖范围：TMB和MSI* |
| 实践时间 | ~ 10.5小时 | 手动:~ 10.5小时 自动化:~ 2.5小时 |
手动:~ 10.5小时 自动化:~ 2.5小时 |
| 输入数量 | 40 ng DNA, 40-80 ng RNA(需要至少2 mm3.FFPE组织) | 40 ng DNA, 40 ng RNA | 30 ng cfDNA (8-10 ml血浆) |
| 方法 | 目标浓缩，目标浓缩，有针对性的DNA测序,有针对性的RNA序列 | 目标浓缩，目标浓缩，有针对性的DNA测序,有针对性的RNA序列 | 目标浓缩，目标浓缩，有针对性的DNA测序 |
| 核酸类型 | DNA, RNA | DNA, RNA | 脱氧核糖核酸 |
| 样本吞吐量 | 每个流池16-192个样品 | ||
| 专门的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | 血液，无细胞DNA，循环肿瘤DNA |
| 物种分类 | 人类 | 人类 | 人类 |
| 系统兼容性 | NovaSeq 6000 | NextSeq 500,NextSeq 550,研究模式下的NextSeq 550Dx | NovaSeq 6000 |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
| 变异类 | 拷贝数变异(CNVs)，基因融合，插入-缺失(indels)，转录本变异 | 拷贝数变异(CNVs)，基因融合，插入-缺失(indels)，转录本变异 | 拷贝数变异(CNVs)，基因融合，插入-缺失(indels)，体细胞变异 |
TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500高通量之间TMB分析的高度一致性。
trusightonology 500和TruSightOncology 500 High Throughput之间的MSI分析具有很高的一致性。
TruSight toncology 500和TruSightOncology 500 High Throughput之间的VAF一致性高。
NextSeq 500系统中使用TruSight Oncology 500检测到的融合和剪接变体。数值表示指示RNA输入量下每个样本的支持读取次数。RNA融合的截止值=5；拼接变体的截止值=10。
TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500高通量的内容包括多种癌症类型的关键指南生物标记物，以及当前和新兴的泛癌症生物标记物，如TMB、MSI、NTRK1、NTRK2和NTRK3。
カスタムプロトコルセレクタ
生成自定义的端到端指令
*基于PierianDx临床知识库，截至2020年3月
