TruSight肿瘤学UMI试剂

下一代测序库的唯一分子标识符(UMIs)纠错。阅读更多…
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TruSight肿瘤学UMI试剂(16项指标,48份样本)

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TruSight®Tumor 170内容集

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用于HiSeq 2500的TruSight cfDNA UMI(48个样本)

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TruSight cfDNA UMI for HiSeq 4000(48样品)

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用于NovaSeq S2的TruSight cfDNA UMI(48个样本)

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製品のハイライト

TruSight Oncology UMI试剂可降低测序数据中的背景噪声,从而能够检测低频变异,如在无细胞DNA(cfDNA)中发现的变异。

减少错误率

循环肿瘤DNA (ctDNA)可能代表cfDNA的很小一部分,接近下一代测序(NGS)检测的极限。TruSight肿瘤UMI试剂通过UMIs和错误校正软件解决了这一挑战,将错误率降低到< 0.007%,并能够检测低频变异。较低的错误率增加了分析的特异性,从而提高了NGS数据的置信度。

集成到TruSight肿瘤学工作流程中

TruSight Oncology UMI试剂包括UMI适配器和索引,以及TruSight Oncology DNA文库制备和富集试剂。这些试剂也可以与TruSight肿瘤170 DNA寡核苷酸配对。集成UMIs不会在库准备工作流程中创建任何额外步骤。

直观的错误修正软件

UMI错误修正应用程序对读取数据进行对齐,然后使用ui来排除误报,减少变体调用错误。UMI Error Correction App可在基于云的BaseSpace Sequence Hub中获取,也可在本地安装。

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仕様

特定于方法的工作流示例

支持数据和数字

背景减少有助于精确的变量调用
背景减少有助于精确的变量调用

为了能够准确检测罕见变异,UMIs与纠错软件集成,使真正的突变能够从背景噪声中区分出来。下面的面板说明了如何通过去除导致假阳性的固有错误,降低错误率使真实突变(红点)与背景噪声(灰点)更好地区分开来。

使用ui降低错误率
顺序运行 平均错误率(未折叠读取) 平均错误率(折叠读取)
1. 0.038% 0.0023%
2. 0.043% 0.0024%
3. 0.035% 0.0024%
4. 0.084% 0.0019%

使用TruSight Oncology UMI reagent与TruSight Tumor 170 DNA含量配对进行文库制备,31个样本在HiSeq 4000系统上进行4次独立测序。使用UMI错误纠正应用程序显示有和没有折叠读取时的平均错误率。

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*对NovaSeq 6000系统的性能进行了演示,但没有进行广泛测试。