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TruSight RNA Pan-Cancer面板はがんトランスクリプトームの包括的な解析が可能です。この製品は以下を特長としています:
TruSight RNA Pan-Cancer面板では,遺伝子発現を定量的に測定することだけでなく,既知および新規の遺伝子融合因子からの遺伝子融合を検出することもできます。このパネルは,わずか10 ngの总RNAのインプット量(FFPEサンプルの場合は20 ng)に対応しています。関連遺伝子のサブセットにフォーカスすることにより,高精度なRNA-Seqがデスクトップ型シーケンサーにおいてランあたり8サンプルで行うことができるため,あらゆるラボで挥动をコスト効率よく利用することができます。
解析はRNA-Seq对齐BaseSpaceアプリを使って行うことができます。この直感的なツールは,融合コールと変異検出を行い,遺伝子発現プロファイルを捉えることができるため,あらゆるがん研究に役立つ包括的なソリューションとなっています。
ヒトリファレンスRNA(表)10 ng,ヒトリファレンス脳RNA(脳)10 ng,細胞株RNA (MCF7) 10 ng,および乳がんFFPE RNA (BT) 20毫克をTruSight RNA Pan-Cancer面板を用いて調製し,MiSeqシステムでシーケンスしました。リードのマッピングおよび融合コールはBaseSpace序列中心においてRNA-Seq对齐アプリと星对准器を併用して実施しました。
ヒトリファレンスRNA (HBRRおよびUHRR),細胞株RNA (MCF7)および乳がんRNAのサンプルをTruSight RNA Pan-Cancer面板を用いて調製し,8サンプルをMiniSeqシステムにおいてシングルインデックスによりリード長2 x76bpでシーケンスしました。全収量は,Q30以上の塩基の96.8%が含まれた4.2 Gbでした。
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装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
---|---|---|
MiniSeq系统 | 每次运行的样本:中输出:2-3,高输出:8(基于每个样本300万读取) | 2 × 75 bp(推荐最大值) |
MiSeq系统 | 使用v3试剂每次运行8个样品(基于每个样品300万reads) | 2 × 75 bp(推荐最大值) |
技术说明| PDF1 MB
产品信息表| EXCEL< 1mb
数据表| PDF< 1mb
カスタムプロトコルセレクタ
生成自定义的端到端指令