Illumina DRAGEN生物it平台

イルミナのDRAGEN(动态读取分析基因组学)看到你平台は精確で超高速なシーケンスデータの二次解析を実現します。阅读更多…
ルミナの德拉根生物信息平台が実現すること
  • 精確なデタ:高い解析感度と特異度で小さなバリアントも検出1
  • 安定したスピド:30×カバレッジの全ヒトゲノムを約25分以内に処理2、3
  • 高頻度のアップデト:定期的な改善やアップデトのリリスも実施
  • 多種多様なアプリケション:全ゲノムシケンス,エクソ(ngs)デ
dragenのオプション
DRAGEN内部
Dragenオンサeconfトサ
DRAGEN内部
NextSeq 1000/2000
超高速解析

DRAGEN平台は従来のCPUベースのシステムでは15時間以上かかっていた30×カバレッジの全ヒトゲノム挥动データ処理を,オンサイトサーバーで約25分以内に完了させます。ゲノムデタ解析の世界最速記録を2打立てました。2、3

費用効率の高いソリュション

DRAGEN平台により,サーバークラスターへのオンプレミス投資とクラウドコンピューティングリソースの利用を抑えることができます。

非常に精確な結果

2018年のPrecisionFDAによる宝藏——热身挑战において,DRAGEN平台は全50バリアントを検出したプラットフォームの中で,全ゲノムバリアントコールに関する6つの精度測定のうち5つで最高スコアを記録しました。1

多様なアプリケション

DRAGEN平台では,全ゲノム,全エクソーム,生殖細胞系列および体細胞系列のデータセット,およびRNAシーケンス実験からのシーケンスデータを解析できます。

高頻度のアップデト

高頻度のアップデートにより,新しいアプリケーションを取り入れ,進化し続ける業界標準に対応しながら,DRAGEN平台を継続的に拡大および改善しています。

バereplicationオereplicationンフォマティクスを社内に導入することで,コストと所要時間を削減

磷の共同創設者兼最高経営責任者である亚历山大Bisignanoは,DRAGEN看到你平台を使用して,オンサイトで手頃な価格でゲノミクスデータ解析を実行する方法について説明します。

帐号ンタビュ帐号を読む
磷数据分析

DRAGEN平台により,あらゆる分野のあらゆる規模のラボでゲノムデータがさらに活用されるようになります。DRAGEN平台は、高度に再構成可能なフィールドプログラマブルゲートアレイテクノロジー(FPGA)を活用して、BCL変換、マッピング、アライメント、ソーティング、デュプリケートマーキング、およびハプロタイプのバリアントコールなどのゲノム解析アルゴリズムをハードウェアアクセラレーションにより実装します。DRAGEN Platformの基本的な機能では、非常に長い計算時間や膨大な量のデータといったゲノム解析において直面することの多い問題に対応しています。

DRAGEN平台は精度を犠牲にすることなく,迅速さ,柔軟性,そして高いコスト効率を実現します。DRAGEN平台では再プログラミングが可能なため、イルミナによるカスタムアルゴリズムの開発が可能となり、将来のアプリケーションに対応するための改善も可能になります。

关键DRAGEN应用程序

DRAGEN服务器 DRAGEN BaseSpace NextSeq 1000/2000
多路分解(BCL转换)
地图和对齐
基因融合与量化
外显子组富集(种系和体细胞) 生殖系只
全基因组(种系和体细胞) 生殖系只
甲基化
联合基因分型
TSO 500液体

DRAGEN也可以通过AWS MarketPlace上的Amazon Machine Image (AMI)购买

DRAGEN BaseSpace序列中心ではDRAGEN平台のスピードと精確さがBaseSpace序列中心のセキュリティ,費用削減,および直感的なインターフェースと組み合わされています。

  • 専門知識のレベルを問わない,タッチパネル操作による解析
  • 装置から直接デタをストリミングして迅速な解析を実現
  • ハドウェア投資が不要で,低コストを実現
  • BaseSpace序列中心および亚马逊网络服务(AWS)のセキュリティ,コンプライアンス,および保管機能を活用

デタシトを読む

BaseSpaceアプリの詳細はこら

DRAGEN在BaseSpace序列集线器

DRAGENオンサイトサーバーでは,高い精度を維持しながら,従来のCPUベースのシステムと比べると非常に短い時間で二次解析を行うことができます。

  • ロカルでのデタの解析と保存
  • さまざまなレベルのコマンドラopenstackンopenstackンタopenstackフェopenstackスに対応
  • 最大30の従来のコンピュンスタンスを代替
  • 30xカバレッジのヒト全ゲノムNGSデタを25分以内に処理
  • フル稼働する2台のNovaSeqシステムに1台で対応

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DRAGEN内部
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广泛的研究所

イルミナシーケンサーとGATKの統合やDRAGEN平台の導入によりハードウェアアクセラレーションとデータ解析の標準化が促進される可能性について,共同研究者である广泛研究所の安东尼Philippakisとイルミナの苏珊Tousiがお話します。

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DRAGENを使ってエクソムから全ゲノムに拡大するGeneDx

GeneDxは,DRAGENを使用することでコストを抑え,短い所要時間と高い精度を保ちながら業務を拡大することができるようになりました。

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雷迪儿童医院

19時間30分という最速の遺伝子診断のギネス世界記録が打立てられました。DRAGEN平台は、シーケンス後のゲノムデータのマッピングとアライメントのスピードを大幅に高めるために使用されました。1

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PrecisionFDA

2018年のPrecisionFDAによる宝藏——热身挑战において,DRAGEN平台は全50バリアントを検出したプラットフォームの中で,全ゲノムバリアントコールに関する6つの精度測定のうち5つで最高スコアを記録しました。2

記事を読む
ポピュレションシケンス

シケンス済みゲノムを迅速に解析。時代とともに改善される解析ルを用いる再解析に必要となる時間を短縮します。

nicuおよび遺伝性疾患

迅速に結果を出すことが極めて重要となる状況で,ゲノム解析にかかる時間を短縮します。

がん研究

腫瘍のみサンプルと腫瘍/正常サンプルの,精確か。

アグリゲノム

多種多様で複雑なゲノムを持,ユ。

臨床研究およびトランスレショナル研究

短い所要時間と高い精度で,再現性と高品質な結果を担保し,タ,ゲットエクソ,ムデ,タを解析します。

参考文献
  1. 精准FDA隐藏宝藏预热。precision.fda.gov / 1 /视图/结果/挑战.已于2018年9月14日访问。
  2. 生物世界。费城儿童医院艾迪科创造了二次分析速度的世界纪录。2017年10月23日。www.bio-itworld.com/2017/10/23/childrens-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed.aspx.已于2018年9月19日登陆。
  3. 圣地亚哥联合论坛报。雷迪儿童学院创造了吉尼斯世界纪录。2018年2月12日。www.sandiegouniontribune.com/news/health/sd -不-拉迪-记录- 20180209 - story.html.已于2018年9月19日登陆。

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