Illumina-COVIDSeq试验

这种高通量下一代测序(NGS)检测从疑似COVID-19患者的鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子中检测SARS-CoV-2。阅读更多…

主要特点和好处
  • 准确性:检测98个SARS-CoV-2目标,实现高精度检测
  • 吞吐量:3072可在NovaSeq 6000系统上运行12小时
  • 质量控制:内部控制包括每个反应中的11个人类mRNA靶点。

製品のハイライト

Illumina-COVIDSeq试验是美国食品和药物管理局紧急使用授权(EUA)批准使用的第一项NGS试验。这种基于扩增子的NGS检测包括2019个nCoV引物和探针组,用于检测疑似新冠病毒19的有感染症状和体征的患者鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子中SARS-CoV-2病毒的RNA。

快速、可扩展的SARS-CoV-2检测

Illumina COVIDSeq测试可以放大或缩小,以适应不同数量的样本。在NovaSeq 6000系统上,使用两个NovaSeq 6000 S4试剂包和Xp工作流程,最多可在12小时内处理3072个结果。

工作流和组件

该工作流程包括病毒RNA提取、RNA到cdna转换、PCR、文库制备、测序、分析和报告生成等步骤。关键组件包括高通量NovaSeq 6000系统、Illumina COVIDSeq测试和DRAGEN COVIDSeq测试管道,用于快速临床结果报告。

设计与质量控制

Illumina COVIDSeq检测采用了经过验证的、公开可用的ARTIC多重PCR协议的改进版本,结合经过验证的Illumina测序技术,有98个扩增子用于扩增SARS-CoV-2病毒特异性序列。作为质量特征,每个样本中包含11个人类mRNA靶标组成的内部控制,以监测错误。

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仕様

预期用途

Illumina COVIDSeq Test是一款新一代测序(NGS)产品。体外用于从鼻咽部(NP)拭子、口咽部(OP)拭子、前鼻拭子、中鼻甲鼻拭子、鼻咽部洗液/吸液、鼻吸液、以及医疗服务提供者对疑似COVID-19患者的支气管肺泡灌洗(BAL)标本。检测仅限于根据1988年临床实验室改进修正案(CLIA), 42 U.S.C.§263a认证的实验室,用于执行高复杂性的检测。结果用于SARS-CoV-2 RNA的鉴定。SARS-CoV-2 RNA通常可在感染急性期的呼吸道标本中检测到。

阳性结果表明存在SARS-CoV-2 RNA;与患者病史和其他诊断信息的临床相关性对于确定患者感染状态是必要的。阳性结果不排除细菌感染或与其他病毒合并感染。美国及其领土内的实验室必须向相关卫生当局报告所有阳性结果。

阴性结果不能排除SARS-CoV-2感染,不应作为患者管理决策的唯一依据。阴性结果必须结合临床观察、病史和流行病学信息。

Illumina COVIDSeq测试适用于经过Illumina NovaSeq 6000测序系统和下一代测序工作流程培训的合格和培训的临床实验室人员体外诊断程序。COVIDSeq尚未获得FDA批准或批准。该测试是FDA在EUA下授权的,在声明存在的情况下授权紧急使用体外诊断用于COVID-19的检测和/或诊断。亚博下载app

请联系Illumina代表了解区域可用性。

高层工作流

常见问题

关于COVIDSeq测试

该试验已获得FDA紧急使用授权(EUA),可作为检测和/或诊断COVID-19的体外诊断试验。

不,这种检测只检测导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒。

本试验采用扩增子方法对SARS-CoV-2进行目标重测序。有关工作流程说明和其他细节,请参阅使用说明文件。

紧急使用授权授权FDA在宣布的紧急状态期间促进未批准产品的供应,或已批准产品的未批准使用。当紧急状态结束时,该检测不再被授权用于临床,并默认符合标准的监管要求。

该测试可提供给数量有限的早期访问客户,这些客户具有高样本量测序经验,并满足工作流程要求,包括完全配备NovaSeq 6000系统、DRAGEN和PCR设备。检测仅限于根据1988年临床实验室改进修正案(CLIA), 42 U.S.C.§263a认证的实验室,用于执行高复杂性的检测。

为了控制全球流行病并重返工作、学校和正常活动,需要进行更多的检测。然而,新冠病毒-19检测相关产品严重短缺,许多临床实验室面临能力和资源限制。COVIDSeq利用高度可扩展和精确的测序技术,使实验室能够扩大和多样化检测,有助于提高COVID-19的检测能力。

本产品在CE-IVD监管的欧洲国家仅用于性能评估(PEO),或在其他非美国国家作为研究用途(RUO)。国家。根据地区和国家的不同,可能需要额外的数据才能将covid - seq用作诊断测试。

COVIDSeq工作流

此检测仅被授权与NovaSeq 6000 S4试剂试剂盒(Xp工作流程)一起使用。使用其他NovaSeq 6000试剂包或Illumina其他测序系统需要独立的验证和单独的紧急使用授权。

本试验获准与鼻咽(NP)、口咽(OP)和中鼻甲(MT)鼻拭子一起使用。

NovaSeq S4流动池上每个车道最多可装载384个样品,每个流动池总共可装载1536个样品。2个流动池可同时运行,每次运行总共3072个样品。

Illumina提供多达384个UD索引(Illumina Nextera DNA唯一双索引集A-D的IDT)。

分析和报告

该测试使用Illumina DRAGEN COVIDSeq测试管道。

如果COVID-19检测结果呈阳性,表明检测出SARS-CoV-2 RNA,患者感染了该病毒,可能具有传染性。在作出最终诊断和病人管理决定时,应始终结合临床观察和流行病学数据考虑实验室检测结果。患者管理应遵循目前的CDC指南。

该检测结果为阴性,表示标本中未出现SARS-CoV-2 RNA超标。然而,阴性结果并不排除COVID-19,不应作为治疗或患者管理决策的唯一依据。如果结果为阴性,也不能排除感染新冠病毒的可能性。

COVIDSeq使用说明

本文档描述了从样品采集到数据分析和报告生成的工作流程,并列出了所需的材料和设备。

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