用于Illumina的AmpliSeqBRCAパネルは、BRCA1およびBRCA2遺伝子の体細胞および生殖細胞系列変異体の研究のためのターゲットリシーケンスアッセイです。主な特長は次のとおりです。
BRCAパネルは、用于Illumina的AmpliSeqのポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースのライブラリー調製、イルミナの1.塩基合成(SBS)次世代シーケンス(NGS)技術、自動化解析を含む統合ワークフローの一部です。
BRCA1およびBRCA2は,特定の突然変異を有する場合,乳がんおよび卵巣がんのリスク増加に関与するがん抑制遺伝子です。このカタログパネルは,ターゲットを特定し,プライマーを設計し,パネルを最適化する時間と労力を節約します。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
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iSeq 100系统 | 每次运行12个样本(假设最小覆盖率为500×) 每次运行96个样本(假设最小覆盖率为50倍) |
2×150bp 2×150bp |
MiniSeq系统 | 每次运行的样本数:中输出:24,高输出:80(假设最小覆盖率为500×) | 2×150bp |
MiSeq系统 | 在500倍最小覆盖率下每次运行的样品(按试剂盒版本):v2纳米:3,v2微米:12,v2:48,v3:80 每次至少覆盖50倍的样品(按试剂盒版本):v2纳米:32,v2微米:96 |
2×150bp 2×150bp |
AmpliSeq用于Illumina BRCA面板 | 特鲁西特癌 | |
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分析时间 | 5小时(仅限图书馆预科;不包括库量化、规范化或池化时间) | 1.5天 |
癌症类型 | 固体肿瘤 | 泛癌 |
内容规范 | 外显子区和侧翼内含子序列BRCA1和BRCA2 | 固定的探针集,丰富了与常见和罕见癌症相关的94个基因和284个SNP。 |
描述 | 小麦种系及体细胞分析研究BRCA1和BRCA2. | 常见和罕见癌症的种系突变检测研究。 |
实践时间 | < 1.5小时 | 5小时 |
投入量 | 1-100纳克(建议每个池10纳克) | 50纳克DNA |
方法 | 扩增测序,靶向DNA测序 | 目标富集目标浓缩,靶向DNA测序 |
多路复用 | 96双指数组合 | 高达96丛 |
特殊样本类型 | 血液,FFPE组织 | 不是FFPE-Compatible |
种类 | 人类 | 人类 |
变量类 | 种系变异、插入缺失(INDEL)、单核苷酸多态性(SNP)、体细胞变异 | 生殖系变异 |