呼吸道病毒Oligo面板
通过全面、快速的目标富集测序，对常见呼吸道病毒（包括新冠病毒-19株）进行高度敏感的检测和鉴定。阅读更多…
面板
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合計：
使用呼吸道病毒寡核苷酸面板和Illumina RNA Prep进行富集，研究人员可以获得下一代测序（NGS）数据，以确认SARS-CoV-2的存在，并推进变异分析研究。不可知论设计允许广泛识别致病性呼吸道病毒。
通过混合捕获方法进行目标富集可以实现高灵敏度检测，而不需要鸟枪宏基因组测序所需的高读取深度。此外，该方法允许获得接近完整的目标序列数据，并为病毒进化或病毒监测提供了变异分析等应用。1.
与其他靶向重测序方法（如扩增子测序）相比，通过混合捕获富集允许显著更大的探针板和更全面的靶区轮廓。此外，用于杂交捕获协议的寡聚物探针即使在高度致突变区域内仍然有效，允许针对快速进化的病毒，如RNA病毒。
该综合工作流程集成了样品制备、文库制备、目标富集、测序和数据分析。该工作流程旨在从总核酸提取中丰富病毒靶点。
提取的RNA的反转录和文库制备使用Illumina RNA Prep进行浓缩，然后使用Illumina呼吸道病毒寡核苷酸板进行浓缩。在Illumina NGS系统上测序后，使用DRAGEN病原体检测管道和IDbyDNA Explorify平台进行数据分析。
| 呼吸道病毒Oligo面板 | 呼吸道病原体ID/AMR富集面板套件（由IDbyDNA Explify提供动力） | |
|---|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 物种分类 | 人类,病毒 | 细菌,病毒 |
| 系统兼容性 | 迷你们,MiSeq,NextSeq 550 | 迷你们,MiSeq,NextSeq 550 |
在一项滴定实验中，将1000到两个拷贝的病毒插入到人类唾液RNA中，Illumina RNA Prep with Enrichment的结果是检测到低至两个拷贝的SARS-CoV-2病毒读取。
| 系统 | 循环次数 | 读数（M） | 运行时间(小时) | 每次运行的样本数（每个样本读取1M） |
|---|---|---|---|---|
| NextSeq 550系统（高输出） | 150 | 400 | 18 | 最大400A. |
| NextSeq 550系统（中输出） | 150 | 130 | 15 | 130 |
| MiSeq系统(v3化学 | 150 | 25 | 21 | 25 |
| MiniSeq系统（高输出） | 150 | 25 | 17 | 25 |
| A.指示每次运行的样本数超过可用的索引数。 | ||||
使用Illumina富集RNA Prep检测和鉴定呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2
申请须知| PDF<1 MB
使用MiniSeq快速试剂试剂盒和Illumina富集RNA试剂盒快速检测呼吸道病毒
申请须知| PDF<1 MB
该NGS小组针对超过280种呼吸道病原体（包括SARS-CoV-2）和1200多种抗药性等位基因，数据分析由IDbyDNA提供支持。
