使用呼吸道病毒寡核苷酸面板和Illumina RNA Prep进行富集,研究人员可以获得下一代测序(NGS)数据,以确认SARS-CoV-2的存在,并推进变异分析研究。不可知论设计允许广泛识别致病性呼吸道病毒。
通过混合捕获方法进行目标富集可以实现高灵敏度检测,而不需要鸟枪宏基因组测序所需的高读取深度。此外,该方法允许获得接近完整的目标序列数据,并为病毒进化或病毒监测提供了变异分析等应用。1.
与其他靶向重测序方法(如扩增子测序)相比,通过混合捕获富集允许显著更大的探针板和更全面的靶区轮廓。此外,用于杂交捕获协议的寡聚物探针即使在高度致突变区域内仍然有效,允许针对快速进化的病毒,如RNA病毒。
该综合工作流程集成了样品制备、文库制备、目标富集、测序和数据分析。该工作流程旨在从总核酸提取中丰富病毒靶点。
提取的RNA的反转录和文库制备使用Illumina RNA Prep进行浓缩,然后使用Illumina呼吸道病毒寡核苷酸板进行浓缩。在Illumina NGS系统上测序后,使用DRAGEN病原体检测管道和IDbyDNA Explorify平台进行数据分析。
呼吸道病毒Oligo面板 | 呼吸道病原体ID/AMR富集面板套件(由IDbyDNA Explify提供动力) | |
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自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
物种分类 | 人类,病毒 | 细菌,病毒 |
系统兼容性 | 迷你们,MiSeq,NextSeq 550 | 迷你们,MiSeq,NextSeq 550 |
使用Illumina富集RNA Prep检测和鉴定呼吸道病毒,包括SARS-CoV-2
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使用MiniSeq快速试剂试剂盒和Illumina富集RNA试剂盒快速检测呼吸道病毒
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