Illumina RNA文库与富集训练准备
20044763
Illumina RNA制备与富集はビーズ上でのタグメンテーション技術を使用しシンプルな1.回のハイブリダイゼーションを行うことで、核糖核酸ベースのライブラリー調製および濃縮を極めて迅速なワークフローにしています。
総所要時間9時間以内,ハンズオンタイム2時間以内でライブラリー調製と濃縮ができます。このワークフローで,TruSeq RNA外显子组と比べ50%超の時間が節約できます。イルミナ認定の自動化オプションは,当社の自動化パートナーを通じてまもなく利用できます。
新鮮/凍結サンプルのトータルRNAであれば10 ng,分解サンプル(FFPEなど)のトータルRNAでも20 ngほどの少量で高感度を達成できます。
ターゲットトランスクリプトームのコード領域だけを対象とすることにより、わずかなシーケンス深度で最大の検出力が得られます。Illumina RNA制备与富集は、優れたキャプチャー効率とカバレッジ均一性をもたらし、バイアスを入れず精確に検出するために必要なシーケンス深度を最小化できるように作られています。各濃縮反応には、わずか2.5微升のプローブが必要です。
さまざまな既製の検証済みプローブプールから選ぶことも,独自のプローブをカスタマイズすることもでき,最大限の柔軟性があります。新しくなったユニークデュアルインデックス集CとD(近日発売予定)により,1回のランで最大384サンプルのマルチプレックスが可能です。目的とする領域の幅広いRNA-Seqアプリケーションに対応するモジュール設計で,アリル特異的発現解析,遺伝子融合検出,バイオマーカースクリーニングなど,さまざまな検出や探索が可能です。
RNAエクソームを含む膨大な数のターゲット遺伝子を迅速に狙って解析します。Illumina RNA制备与富集に、コーディングRNA配列を網羅的にカバーする高度に最適化されたプローブセット、Illumina Exome Panelを組み合わせることもできます。Illumina Exome Panelには425,000を超えるプローブが含まれます。各プローブはNCBI37/hg19のリファレンスゲノムに対して構築され、RefSeqエクソームの98%超を網羅しています。このプローブセットで、目的とする21,415個の遺伝子に及ぶ214,000個を超えるターゲットをキャプチャーできます。
呼吸道病毒寡聚物小组は、コロナウイルス株を含む一般的な呼吸器系ウイルスの高感度検出と特性解析が可能です。ハイブリキャプチャー法によるターゲット濃縮に使用するオリゴプローブは、高変異領域内であっても効率的なため、急速に進化する核糖核酸ウイルスをターゲットにすることができます。呼吸道病毒寡聚物小组はIllumina RNA制备与富集と組み合わせて使用します。
詳細はこちら装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
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NextSeq 550系统 | Illumina RNA制备与富集+外显子组面板 中期产量:5 高输出:16 (基于每个样本2500万次读取) |
2 × 100 bp |
NextSeq 2000系统 | Illumina RNA制备与富集+外显子组面板 P2:16 P3:40 (基于每个样本2500万次读取) |
2 × 100 bp |
NovaSeq 6000系统 | Illumina RNA制备与富集+外显子组面板 SP:32 S1:64 S2:164 S4:384 (基于每个样本2500万次读取) |
2 × 100 bp |
MiSeq系统 | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 多达25个样品(基于1M读取每个样品) |
2 × 75 bp |
MiniSeq系统 | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 多达25个样品(基于1M读取每个样品) |
2 × 75 bp |
NextSeq 550系统 | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 最多384个样本(基于每个样本100万次读取) |
2 × 75 bp |
Illumina RNA制备与富集 | TruSeq RNA外显子组 | Illumina单链mRNA制备 | |
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自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
方法 | 信使rna序列,目标浓缩目标浓缩,有针对性的RNA序列 | 外显子组测序,信使rna序列 | 信使rna序列 |
技术 | 排序 | 排序 | 排序 |
变量类 | 基因融合,新转录,单核苷酸多态性(SNPs),转录变体 | 新转录本、单核苷酸多态性(SNPs)、转录本变体 | 基因融合,新转录,单核苷酸多态性(SNPs),转录变体 |
使用MiniSeq系统全面快速检测呼吸道病原体和相关耐药基因
应用笔记| PDF< 1mb
使用Illumina RNA Prep进行呼吸道病毒(包括SARS-CoV-2)的检测和鉴定
应用笔记| PDF< 1mb
应用笔记| PDF< 1mb
应用笔记| PDF< 1mb
使用MiniSeq快速试剂盒和Illumina RNA Prep富集技术快速检测呼吸道病毒
应用笔记| PDF< 1mb
应用笔记| PDF< 1mb
手册| PDF1 MB
小册子| PDF2 MB
数据表| PDF6版本
数据表| PDF<1 MB
数据表| PDF6版本