Illumina单链mRNA制备
インプット量わずか25纳克の標準（未分解）核糖核酸を利用してコーディングトランスクリプトームを解析できるシンプルで拡張性が高くコスト効率の良い、1.日で完了できる迅速ソリューション。阅读更多。。。
Illumina公司滞留mRNA预科は効率化を実現したRNA-Seqソリューションであり,トランスクリプトームを明確かつ網羅的に解析することができます。さまざまなサンプルタイプに柔軟に対応し,トータルRNA25 ngという少ないインプット量に対応できます。Illumina单链mRNA制备は、ストランドの向きを精確に測定することができます。また、均一なカバレッジを実現し、未知のアイソフォーム、遺伝子融合、アリル特異的発現といったさまざまな特徴を確実に検出することができます。
Illumina单链mRNA制备は、優れた波利亚キャプチャー効率とカバレッジ均一性の実現に最適です。コーディングトランスクリプトームを、精確にバイアスなしに検出するために必要なシーケンス深度を最小にできます。Illumina单链mRNA制备は、2011年以来9,926報もの文献に引用されている特鲁塞克ライゲーション技術を基にしています。
Illumina链总RNA制备は、25ng～1000ng＊の幅広いRNAインプット量に対応します。
ストランドの向きの情報によって、アンチセンス転写産物の検出、転写アノテーションの促進、アライメント効率の向上が可能です。
7.時間以内にシーケンス用のライブラリーを調製します。イルミナ認定の自動化オプションは、当社の自動化パートナーを通じてまもなく利用できます。
1.回のランで最大384サンプルをマルチプレックスし、シーケンスできます。（索引集A）とBは現在発売中、集合CとDは近日発売予定）
RNA序列は、ある時点でのトランスクリプトームの詳細なスナップショットが得られるため、第一人者が好んで使用するプラットフォームになりつつあります。定量聚合酶链反应に勝る以下のような多くの利点を備えています。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 中期产量：5 高产量：16 （基于每个样本2500万次读取） |
2×75bp |
| NextSeq 2000系统 | P2:16 P3:40 （基于每个样本2500万次读取） |
2×75bp |
| NovaSeq 6000系统 | SP:32 S1:64 S2:164 S4: 384 （基于每个样本2500万次读取） |
2×75bp |
| Illumina单链mRNA制备 | TruSeq滞留mRNA | TruSeq RNA文库准备试剂盒v2 | Illumina RNA制备与富集 | Illumina绞合总RNA制备及核糖零加 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 链特异性 | 搁浅 | 搁浅 | Non-Stranded | Non-Stranded | 搁浅 |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 |
| 变量类 | 基因融合，新转录，单核苷酸多态性（SNPs），转录变体 | 基因融合，新转录，单核苷酸多态性（SNPs），转录变体 | 基因融合，新转录，单核苷酸多态性（SNPs），转录变体 | 基因融合，新转录，单核苷酸多态性（SNPs），转录变体 | 基因融合，新转录，单核苷酸多态性（SNPs），转录变体 |
左: Illumina公司滞留mRNA预科の性能指標右：IlluminaをTruSeq链mRNAと比較しました。その結果、Illumina单链mRNA制备は、特にインプット量25纳克のUHR-RNAで、より優れた性能を示しました。ライブラリーを30米リードにサブサンプリングし、BaseSpace RNA-Seq校准应用程序v2.0.1で解析しました。复制は、4米のペアエンドリードパスフィルター（PF）にサブサンプリングしたときのものです。
Illumina单链mRNA制备は、少ない核糖核酸インプット量で、TruSeq链mRNAよりも多くの遺伝子を検出することができました。検出遺伝子数は、30米のペアエンドリードPFにサブサンプリングしたときのものです。Illumina单链mRNA制备は、1×のカバレッジでより多くの遺伝子を検出したことから、より高い感度を有すると言えます。
Illumina单链mRNA制备では、TruSeq链mRNAとの一致率の高いデータが得られます（A:UHR RNAインプット量は両製品とも同じで100ng，B:UHR-RNAインプット量はIllumina单链mRNA制备のほうが25纳克と少なく、TruSeq链mRNAは100纳克）
Illumina单链mRNA制备は、25纳克のUHR-RNAのテクニカルレプリケート間（A）でも、またUHR-RNAインプット量25纳克と100纳克との間（B）でも、高いデータ一致率を示しました。ライブラリーを74bp×2でシーケンスし、30米リードにサブサンプリングしました。データ解析にはBaseSpace RNA-Seq校准应用程序v2.0.1を使用しました。
Illumina单链mRNA制备は迅速ワークフローで、ハンズオンタイムを短縮できます。ハンズオンタイムは、使用する装置、処理サンプル数、自動化手順、ユーザーの経験値によって異なります。
数据表| PDF|6个版本
Illumina链mRNA和总RNA工作流程的读取修剪最佳实践
技术说明| PDF<1 MB
应用笔记| PDF< 1mb
手册| PDF1 MB
手册| PDF2 MB
コーディングおよびノンコーディングトランスクリプトーム研究用の広範な種類のサンプルから迅速にライブラリーを調製して、他に類を見ない柔軟性を持って研究を行うことができます。