Illumina链总RNA Prep与核糖零度加
コーディングおよびノンコーディングトランスクリプトーム研究用の広範な種類のサンプルから迅速にライブラリーを調製して,他に類を見ない柔軟性を持って研究を行うことができます。阅读更多…
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Illumina链总RNA库预备训练
20044764
合計：
Illumina链总RNA库预备训练
20044764
Illumina公司总RNA与Ribo-Zero预科加上には,コーディングRNAとさまざまな形状のノンコーディングRNAを解析できる卓越した性能があります。選択的転写産物,遺伝子融合,アリル特異的発現を高い信頼度で検出できます。
Illumina公司总RNA与Ribo-Zero +は预科,2011年以9926年来報もの文献に引用されているTruSeqライゲーション技術を基にしています。このライゲーション法では,高いカバレッジ均一性と精確なストランド情報が得られ,分解サンプルからでも堅牢で信頼性のあるライブラリー調製が可能です。
Illumina公司总RNA与Ribo-Zero预科+はng 1 ~ 1000 ng＊の広範なRNAインプット量に対応します。ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)や低品質サンプルを含むさまざまなサンプルタイプに対応できます。同梱のRibo-Zero +はヒト,マウス,ラット,細菌、疫学サンプルなど複数の生物種に由来する多量のRNAを除去できます。
わずか7時間でライブラリーを調製できます。イルミナ認定の自動化法は,当社の自動化パートナーを通じてまもなく利用できます。
384年1回のランで最大サンプルをマルチプレックスし,シーケンスできます。(索引设置とBは現在発売中,集CとDは近日発売予定)1回のランでシーケンスできるサンプル数は,シーケンサーのスループット性能によって変わります。
＊このインプット範囲は高品質RNAに当てはまるものです。FFPEや分解サンプルの場合,最良の結果を得るには10 ngのインプット量を推奨します。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 中期输出:2 高输出:8 (基于每个样本50M读取) |
2 × 75 bp |
| NextSeq 2000系统 | 全转录组分析: 每次运行8 (P2)-20 (P3)样本(基于每个样本50M读取数据) |
2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000系统 | 全转录组分析: SP: 16 S1: 32 S2: 82 S4: 200 每次运行的样本(基于每个样本50M读取) |
2 × 75 bp |
| Illumina链总RNA Prep与核糖零度加 | TruSeq链总RNA | 含零核球蛋白的TruSeq链总RNA | |
|---|---|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 方法 | Whole-Transcriptome测序 | Whole-Transcriptome测序 | Whole-Transcriptome测序 |
| 物种分类 | 细菌，人类，老鼠，老鼠，病毒 | 人类,老鼠,老鼠 | 人类,老鼠,老鼠 |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
上：Illumina带核糖零正的总RNA制备を使用した複数生物種の核糖核酸除去。Illumina绞合总RNA制备及核糖零加を使用することで、ヒト、マウス、ラット、細菌の核糖核酸を単一チューブ反応で効率的に除去することができます。TruSeq链总RNA与核糖零金を使用した哺乳類での結果と、TruSeq链总RNA与核糖零细菌を使用した大腸菌での結果（枯草菌についてはデータの提示なし）を比較しました。下: Illumina公司总RNA链预科Ribo-Zero +によるヒト末梢血白血球からのグロビンmRNA除去
Illumina公司总RNA链预备は,(A)高品質表RNAや人工的に分解した表RNA (RIN値= 2)や,(B)インプット量100 ngおよび10 ngのFFPE RNAで,高いカバレッジ均一性を示します。FFPEサンプルのDV200クオリティスコアは55%でした。ライブラリーはすべて,NovaSeq 6000システムにて50米リードでシーケンスしました。データ解析にはBaseSpace RNA-Seq对齐应用v2.0.1を使用しました。
上:性能指標の比較Illumina公司总RNA链与Ribo-Zero预科+を使用した場合と,TruSeq困总RNA与Ribo-Zeroを使用した場合とで比較しました。Illumina公司总RNA链与Ribo-Zero预科+を使用した場合で,特にトータル表RNA量10 ngおよび1 ngという少ないインプット量において,より高い効率性が認められました。550年ライブラリーをNextSeqシステムでシーケンスし,30米リードにサブサンプリングしました。4 mリードにサブサンプリングし,BaseSpace RNA-Seq对齐软件v2.0で解析して,重复の割合を算出しました。下: Illumina公司总RNA链预科Ribo-Zero +を使用した場合の性能指標
Illumina公司总RNA链预科は,表RNAインプット量100 ngとngとの間(A)でも,また10 ngのFFPE RNAのテクニカルレプリケート間(B)でも,高いデータ一致率を示しました。6000年ライブラリーをNovaSeqシステムにて74 bp×2でシーケンスしました。データ解析にはBaseSpace RNA-Seq对齐应用v2.0.1を使用しました。
Illumina公司总RNA链预科は迅速ワークフローで,ハンズオンタイムを短縮できます。ハンズオンタイムは,使用する装置,処理サンプル数,自動化手順,ユーザーの経験値によって異なります。
数据表| PDF6版本
Illumina链mRNA和总RNA工作流程读取修剪的最佳实践
技术说明| PDF< 1mb
应用笔记| PDF< 1mb
小册子| PDF1 MB
小册子| PDF2 MB
数据表| PDF6版本
インプット量わずか25 ngの標準(未分解)RNAを利用してコーディングトランスクリプトームを解析できるシンプルで拡張性が高くコスト効率の良い,1日で完了できる迅速ソリューション。
