TruSeq基因外显子组には2つの構成オプションがあります。これまでのTruSeq外显子组图书馆准备工具包(カタログ番号fc - 150 - 1001, fc - 150 - 1002, fc - 150 - 1003およびfc - 150 - 1004)は,TruSeq外显子组装备という新しい名称になり,完全なキット製品としてご利用できます。キットには,ライブラリー調製,インデックスアダプター,濃縮試薬およびエクソームパネルのすべてのイルミナ試薬が含まれています。イルミナのTruSeq DNA库准备工具包とIDTのxGen外显子组浓缩との組み合わせを実現するために,主要コンポーネント(例えばライブラリー調製およびインデックスアダプター)は別売で購入できます。個別に購入できるコンポーネントの全リストは,“お客様のコンポーネントを選択”タブでご覧いただけます。IDTのxGen外显子组浓缩のために必要な試薬の購入については,踊跃参与にお問い合わせください。
TruSeq外显子组套件(旧称はTruSeq Exome库准备套件）は、コスト効率のよいライブラリー調製およびエクソーム濃縮ソリューションです。この製品は以下を特長としています：
KitはTruSeq外显子组,12プレックスの濃縮前ライブラリープーリングをサポートしているため,1つのフローセルレーンにつき最大12ライブラリーのシーケンスを行って,シーケンススループットを最大化し,バリアントを同定することができます。さらに,ランごとにシーケンスできるエクソームが増えたことにより,予算を最大限に有効利用することが可能になります。
カバレッジ予測値の算出に関する詳細は、シーケンスカバレッジカルキュレーターをご覧ください。
効率よく経済的にエクソームシーケンスを行うために,TruSeq外显子组装备はオンターゲット率80%以上でのシーケンスリードを実現しています。KitをTruSeq外显子组,1塩基合成(SBS)テクノロジーに基づいたイルミナのシーケンサーと併用すれば,真のコーディング領域のバリアントを検出し,コールの偽陽性率および偽陰性率を最小限に抑えることができます。
イルミナでは,ライブラリー調製からデータ解析までをサポートする統合ワークフローを提供しています。このエクソームシーケンスワークフローを構成するすべてのステップのデザイン,最適化,および解析の検証は総合的に行われています。工程内のすべてのステップで,専門知識を有するイルミナのサイエンティストが技術および専門分野に関する単独サポートを行っています。
イルミナはお客様のワークフローの柔軟性を実現するためにモジュール製品をご提供しています。
イルミナは,xGen®外显子组研究小组v1.0を用いた統合されたエクソーム濃縮ソリューションを共同販売するためにIDTと協力しています。xGen® Exome Research Panel v1.0は、429,826の個別に合成され品質コントロールされたxGen Lockdown®プローブから構成されます。パネルはヒトゲノムの39 Mbターゲット領域（19,396遺伝子）に及び、51 Mbの包括的領域を網羅します。xGen Blocking Oligos（カタログ番号1075474、1075475、または1075476はTruSeq libraries用、Nextera libraries用はIDTにお問い合わせください)およびxGen封锁试剂(カタログ番号1072280または1072281)も必要です。
IDT xGen外显子组研究小组v1.0の詳細はこちら
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 每次运行的样本数：中输出：3，高输出：12（基于5000万次读取，50×覆盖率，4 Gb数据） | 2 × 75 bp(推荐最大值) |
| HiSeq 2500系统 | 每次运行的样本(双流单元):快速运行:24个，高输出:156个(基于5000万个读取，50×覆盖，4gb数据) | 2 × 75 bp(推荐最大值) |
| NovaSeq 6000系统 | 每次运行的样本(双流单元):S1: 160, S2: 320, S4: 769(基于5000万读取，50×覆盖，4gb数据) | ≤2 × 100 bp |
| TruSeq基因外显子组 | Nextera基因外显子组 | AmpliSeq for Illumina Exome Panel | Nextera Flex for Enrichment | |
|---|---|---|---|---|
| 分析时间 | 2.5天 | <2.5天 | < 7.5小时(仅限图书馆准备;不包括库量化、规范化或池化时间) | 约6.5小时 |
| 内容规范 | 捕捉编码外显子。覆盖45mb外显子含量(≥98%的RefSeq, CCDS和Ensembl编码含量)。 | 捕捉编码外显子。覆盖45mb外显子含量(≥98%的RefSeq, CCDS和Ensembl编码含量)。 | CCDS的97% | 外显子组:45mb外显子含量(≥98%的RefSeq、CCDS和Ensembl编码含量)。 自定义:0.5 - 15mb基因组内容的兴趣。 固定面板:内容变化的面板。 |
| 描述 | 一个具有成本效益的外显子组研究工作流集中于≥98%的RefSeq、CCDS和Ensembl编码内容。 | 一个具有成本效益的外显子组研究工作流集中于≥98%的RefSeq、CCDS和Ensembl编码内容。 | 使研究人员能够在<7.5小时内以<1.5小时的实际操作时间准备8个外显子组库。 | |
| 实践时间 | 6小时 | 3个小时 | < 1.5小时 | ~ 2个小时 |
| 投入量 | 100 ng基因组DNA | 50 ng基因组DNA | 50 ng最低 | ≥50ng(不定量);10 ng(定量) |
| 的作用机制 | 机械破碎(Covaris)和生物素化捕获探针的外显子富集 | 基于转座酶的片段化和生物素化捕获探针的外显子富集 | 多重聚合酶链反应 | Enrichment-compatible, bead-linked transposome |
| 方法 | 外显子组测序 | 外显子组测序 | 扩增子测序，外显子组测序 | 自定义排序,外显子组测序，目标浓缩目标浓缩,有针对性的DNA测序 |
| 多路复用 | 高达12倍浓缩 | 高达12倍浓缩 | 96双指标组合 | 多达96个可用的惟一双索引。预富集池高达12倍的测试。 |
| 目标读 | > 80% | > 75% | > 80% | |
| 特殊样本类型 | FFPE组织 | 低输入样本，与FFPE不兼容 | 不是FFPE-Compatible | 血液，FFPE组织，唾液 |
| 物种分类 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类,其他 |
| 均匀性 | >85%(%覆盖率在20x为4 Gb) | >75%(%覆盖率在20x为4gb) | >90% (4gb, 20x， %覆盖率) |
効率よく経済的にエクソームシーケンスを行うために,TruSeq外显子组装备はオンターゲット率80%以上でのシーケンスリードを実現しています。
| 产品目录号 | 总样本 | 富集反应次数 | 索引适配器 |
|---|---|---|---|
| 20020614 | 24 | 8 | 24个单索引(集合A和集合B) |
| 20020615 | 96 | 8 | 96组合对偶指标 |
