我们的链总RNA库制备溶液是为人类、小鼠、大鼠和植物序列设计的,但可能适用于多种真核生物物种。下表列出了经过实验室测试并得到Illumina全面支持的生物体在网上,或由我们的客户报告工作。Illumina不能保证根据客户报告的结果去除rRNA。
样本 | 核糖体rna的目标 |
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人类细胞质核糖体rna | 28秒,18秒,5.8秒,5秒 |
人类线粒体核糖体rna | 12, 16 s |
人类球蛋白转录本 | Hba1 hba2 hbb hbg1 hbg2 |
小鼠和大鼠rRNA | 16 s, 28 s |
克(-)细菌核糖体rna | 大肠杆菌:5 s, 16 s, 23岁 |
革兰氏(+)细菌rRNA | 枯草芽孢杆菌:5 s, 16 s, 23岁 |
生物 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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蜜蜂(的蜜蜂) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
鸡(背带吊裤带) | 删除5S、18S和28S RRNA。线粒体rRNA未检测。 | |||
Ciona intestinalis | 去除18srrna。其他未测试的rRNA。 | |||
炭疽菌higginsianum | 将删除28S和5.8S rRNA。不会移除5S rRNA。未评估18S rRNA。 | |||
桡脚类动物的物种 | 删除28S和18S rnas。其他rnas未被评估。 | |||
牛 | ||||
盘基网柄菌discoideum | 从高质量RNA中去除28S和18S rRNA。将不会删除小rRNAs。 | |||
狗 | ||||
雪貂(Mustela putorius) | ||||
雀(Carpodacus mexicanus) | 移除5S和18S rRNA。不会移除18S rRNA。线粒体rRNAs未测试。 | |||
面粉甲虫(种有害castaneum) | ||||
蛙(非洲爪蟾蜍) | ||||
果蝇(果蝇) | 不会移除5S rRNA或28S rRNA的“正确”片段。 | |||
真菌(黑曲霉) | 18S rRNA的300 nt区域不会从降解的样品中去除。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
真菌(担子菌类) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
真菌(白色念珠菌) | ||||
真菌(新型隐球菌) | 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
真菌(Yarrowia lipolytica) | 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
马(马) | ||||
人类 | 除血液外的所有组织;使用TruSeq链总rna和零核球蛋白用于血液样本。 | |||
昆虫(Rhodnius prolixus) | 尽可能使用高质量的RNA。线粒体rRNA未移除。 | |||
七鳃鳗 | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
海洋海绵(克拉姆) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
猴子(短尾猿;食蟹猴) | ||||
猴子(非洲绿;Chlorocebus sabaeus) | ||||
猴子(恒河猴;解剖) | ||||
蚊子(冈比亚按蚊) | 删除18 s rRNA。不会去除5S, 5.8S和12S, 16S线粒体rRNA。28S rRNA未检测。 | |||
鼠标 | 除血液外的所有组织;使用TruSeq链总rna和零核球蛋白用于血液样本。 | |||
线虫(秀丽隐杆线虫) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
纽特(绿背虱) | 不能移除5.8S或5S rnas。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
恶性疟原虫 | 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。 | |||
Poeciliid鱼 | 移除28S和18S rRNA。可能不能删除所有5S rRNA。 | |||
老鼠 | 除血液外的所有组织;使用TruSeq链总rna和零核球蛋白用于血液样本。 | |||
大马哈鱼(大西洋鲑) | 删除18S、5.8S和5S rnas。不会移除28S rRNA。未检测线粒体rnas。 | |||
海葵(翻译起始因子) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
猪 | 删除28S、18S、5.8S和5S rnas。 | |||
刚地弓形虫 | 使用高质量的RNA。 | |||
锥虫属brucei | 将清除28S和18S rRNA。其他rRNA未被评估。 | |||
大葱(葱属植物fistulosum) | 去除18srrna。其他未测试的rRNA。 | |||
斑马鱼(鲐鱼类) |
生物 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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人类 | 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金 | |||
鼠标 | 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金 | |||
老鼠 | 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金 |
生物 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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拟南芥 | 与叶子、种子和根相容。 | |||
鹰嘴豆(菊苣) | 去除4.5S、16S、23S叶绿体rRNA和18S细胞质rRNA。不会去除5S叶绿体和5S细胞质rRNA。其他rrna未检测。 | |||
玉米 | 与叶子、种子和根相容。 | |||
棉花 | ||||
真核绿藻(衣藻) | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
小道消息 | ||||
日本忍冬(金银花粳稻) | ||||
玉米 | 与叶子、种子和根相容。 | |||
布什的镜子(Coprosma被) | ||||
苔藓(Physcomitrella) | ||||
Prorocentrum最低 | 移除18S和28S rRNA。其他rrna未检测。 | |||
大米 | 与叶子、种子和根相容。 | |||
大豆 | 与叶子、种子和根相容。 | |||
番茄(茄属植物lycopersicum) | ||||
越南胡荽(红脚鹬odorata) | ||||
水三叶草(Marsilea vistita) | ||||
大葱 | 尽可能使用高质量的RNA。 | |||
小麦 | 与叶子、种子和根相容。 |
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