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链总RNA物种相容性

生物兼容性的细节

我们的链总RNA库制备溶液是为人类、小鼠、大鼠和植物序列设计的,但可能适用于多种真核生物物种。下表列出了经过实验室测试并得到Illumina全面支持的生物体在网上,或由我们的客户报告工作。Illumina不能保证根据客户报告的结果去除rRNA。

RNA测序的好处

RNA-Seq使用下一代测序分析转录组的表达,使研究人员能够检测已知或新的特征并量化RNA。

亚博官网人口
Illumina链总RNA Prep与核糖零度加
样本 核糖体rna的目标
人类细胞质核糖体rna 28秒,18秒,5.8秒,5秒
人类线粒体核糖体rna 12, 16 s
人类球蛋白转录本 Hba1 hba2 hbb hbg1 hbg2
小鼠和大鼠rRNA 16 s, 28 s
克(-)细菌核糖体rna 大肠杆菌:5 s, 16 s, 23岁
革兰氏(+)细菌rRNA 枯草芽孢杆菌:5 s, 16 s, 23岁

TruSeq链总rna -含零核糖核酸人/小鼠/大鼠
TruSeq链总rna -含零核糖金
生物 实验室测试 在网上测试 客户报告 评论
蜜蜂的蜜蜂 尽可能使用高质量的RNA。
背带吊裤带 删除5S、18S和28S RRNA。线粒体rRNA未检测。
Ciona intestinalis 去除18srrna。其他未测试的rRNA。
炭疽菌higginsianum 将删除28S和5.8S rRNA。不会移除5S rRNA。未评估18S rRNA。
桡脚类动物的物种 删除28S和18S rnas。其他rnas未被评估。
盘基网柄菌discoideum 从高质量RNA中去除28S和18S rRNA。将不会删除小rRNAs。
雪貂Mustela putorius
Carpodacus mexicanus 移除5S和18S rRNA。不会移除18S rRNA。线粒体rRNAs未测试。
面粉甲虫种有害castaneum
非洲爪蟾蜍
果蝇果蝇 不会移除5S rRNA或28S rRNA的“正确”片段。
真菌黑曲霉 18S rRNA的300 nt区域不会从降解的样品中去除。尽可能使用高质量的RNA。
真菌担子菌类 尽可能使用高质量的RNA。
真菌白色念珠菌
真菌新型隐球菌 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。
真菌Yarrowia lipolytica 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。
人类 除血液外的所有组织;使用TruSeq链总rna和零核球蛋白用于血液样本。
昆虫Rhodnius prolixus 尽可能使用高质量的RNA。线粒体rRNA未移除。
七鳃鳗 尽可能使用高质量的RNA。
海洋海绵克拉姆 尽可能使用高质量的RNA。
猴子(短尾猿;食蟹猴
猴子(非洲绿;Chlorocebus sabaeus
猴子(恒河猴;解剖
蚊子冈比亚按蚊 删除18 s rRNA。不会去除5S, 5.8S和12S, 16S线粒体rRNA。28S rRNA未检测。
鼠标 除血液外的所有组织;使用TruSeq链总rna和零核球蛋白用于血液样本。
线虫秀丽隐杆线虫 尽可能使用高质量的RNA。
纽特绿背虱 不能移除5.8S或5S rnas。尽可能使用高质量的RNA。
恶性疟原虫 不会移除5.8S或5S rrna。尽可能使用高质量的RNA。
Poeciliid鱼 移除28S和18S rRNA。可能不能删除所有5S rRNA。
老鼠 除血液外的所有组织;使用TruSeq链总rna和零核球蛋白用于血液样本。
大马哈鱼大西洋鲑 删除18S、5.8S和5S rnas。不会移除28S rRNA。未检测线粒体rnas。
海葵翻译起始因子 尽可能使用高质量的RNA。
删除28S、18S、5.8S和5S rnas。
刚地弓形虫 使用高质量的RNA。
锥虫属brucei 将清除28S和18S rRNA。其他rRNA未被评估。
大葱葱属植物fistulosum 去除18srrna。其他未测试的rRNA。
斑马鱼鲐鱼类

TruSeq链总rna与零核糖珠蛋白
生物 实验室测试 在网上测试 客户报告 评论
人类 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金
鼠标 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金
老鼠 血液样本;对于所有其他组织,使用TruSeq链总rna -含零核糖核酸的人/小鼠/大鼠或TruSeq链总rna -含零核糖核酸金

TruSeq链总rna与零核糖植物
生物 实验室测试 在网上测试 客户报告 评论
拟南芥 与叶子、种子和根相容。
鹰嘴豆菊苣 去除4.5S、16S、23S叶绿体rRNA和18S细胞质rRNA。不会去除5S叶绿体和5S细胞质rRNA。其他rrna未检测。
玉米 与叶子、种子和根相容。
棉花
真核绿藻衣藻 尽可能使用高质量的RNA。
小道消息
日本忍冬金银花粳稻
玉米 与叶子、种子和根相容。
布什的镜子Coprosma被
苔藓Physcomitrella
Prorocentrum最低 移除18S和28S rRNA。其他rrna未检测。
大米 与叶子、种子和根相容。
大豆 与叶子、种子和根相容。
番茄茄属植物lycopersicum
越南胡荽红脚鹬odorata
水三叶草Marsilea vistita
大葱 尽可能使用高质量的RNA。
小麦 与叶子、种子和根相容。

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