客户面试

改良されたイルミナライブラリー調製キットは理想的なソリューション:お客様の声

澳大利亚基因组研究机构(AGRF)

改良されたイルミナライブラリー調製キットは理想的なソリューション:お客様の声

改良されたイルミナライブラリー調製キットは理想的なソリューション:お客様の声

概要:
AGRFは、品質と革新を約束する非営利団体です。AGRFは、ゲノミクスに関する知識や専門性を共有するためのパートナーを積極的に求めています。AGRFは、オーストラリアにおけるその全国的なネットワークを通じて、生物医学、農業、環境分野におけるゲノミクスを可能にする革新的な先端技術へのアクセスを提供しています。

イルミナは,2020年6.月に3.種類の新しい核糖核酸ライブラリー調製キットを、2020年7.月に新しい无DNA PCRライブラリー調製キットを発売しました。Noune博士とチームは,より迅速で少量インプットに対応,低コストのライブラリー調製ワークフローを提供するこれらの新キットを評価しました。

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克里斯托弗·努恩博士は、メルボルンに拠点を置く澳大利亚基因组研究机构(AGRF)の国家下一代测序经理です。

问:それぞれのキットで良いと評価された特長は何でしょうか吗?

A.新しいIllumina Illumina单链mRNA制备,连接は、少量インプットの場合および多量インプットの場合も高いパフォーマンスを示し、異なるインプット間でも検出されたトランスクリプトの高い一致を示しました。さらに、このキットは低品質の核糖核酸でも高いパフォーマンスを示し、さらに処理を最適化することで1.日に凝縮できる合理的なワークフローだということが分かりました。これは、最適化されていないプロトコルを使用した場合でも、96サンプルの処理時間を35%削減(6.5時間に対して10時間)できることから、特鲁塞克™と比較して非常に優れていることがわかります。

Illumina用Ribo-Zero Plus进行链总RNA预备结扎にも同様のメリットがありますが、加えて、核糖核酸除去モジュールが複数生物種に対してユニバーサルに使えることで、異なるディプリーションタイプのストックを必要とせず、すべてのサンプルを同じキットで処理することができます。種別ごとに異なる複数の核糖核酸除去モジュールを適用するのではなく、単一の核糖核酸除去モジュールを適用できるため、時間を節約できます。

Illumina DNA无PCR制备では,プロトコルがシンプルであるため,1.5 ~ 2時間という短時間でライブラリーを作製することができました。これは,TruSeq PCR-Freeが従来,機械的な断片化と追加のQCチェックを含めて1 ~ 1.5日かかっていたことを考えると,隔世の感を抱かせる飛躍と言えます。このプロトコルに記載されている低インプットワークフローにより,より多くの研究者にPCR-Freeを提供することができます。

全体的に見て、今回評価したすべてのキットのイルミナのプロトコルはよくできていて、簡単に実施することができ、従来品よりもはるかに速くなっていました。

问:阿格拉夫におけるイルミナのライブラリー調製キットの今後の利用予定を教えてください。

A.私たちは、既存の特鲁塞克ファミリーから新しいIllumina Prepファミリーへの移行を計画しています。これにより、AGRFには以下のようないくつかのメリットがもたらされます。

  1. AGRFの受託サービスメニューの合理化
  2. 特鲁塞克ファミリーと比較して、低コストで迅速なライブラリー調製
  3. 必要なインプット脱氧核糖核酸が大幅に少なくて済むため、AGRFから无PCRを全ゲノムシーケンスの標準サービスとして提供することが可能

“Illumina公司滞留总准备とIllumina公司滞留mRNA预备は,少量インプットでも多量インプットと変わらず高い性能を示しました。Ribo-Zero + rRNA除去モジュールは,さまざまなサンプルからrRNAコンテンツを大幅に除去させることが示されました。核糖体rna除去モジュールは複数生物種にユニバーサルに使えることで,異なるrRNA除去試薬のストックを必要とせず,同じキットでサンプルを処理することができます。全体的に高性能で柔軟性があり,1日で完了するワークフローとなっていることから,これらのキットはRNAライブラリー調製の理想的なソリューションとなっています。”

本事例紹介で取り上げられている製品の詳細はこちら:

迅速なライブラリー調製キットポートフォリオ
jp.illumina.com/technologies/sequencement/ngs-library-prep.html

シンプルなRNA序列ワークフロー
jp.illumina.com/techniques/sequencing/ngs-library-prep/rna.html

仅供研究使用。不用于诊断程序(特别注明的除外)。