澳大利亚基因组中心扩大其服务，与世界各地的研究人员合作
NovaSeq 6000系统测序成本低，促进新项目和客户增长。
澳大利亚基因组中心扩大其服务，与世界各地的研究人员合作
总结
概述
迪肯基因组中心想提供和执行更大、更雄心勃勃的测序项目。
挑战
找到一个高吞吐量NGS系统，可以为更大的测序项目扩展并支持各种应用。
解决方案
Chris Austin教授和他的团队选择了Novaseq 6000系统。
好处
Novaseq 6000系统正在支持Dakin University Research和中心作为基因组学枢纽的增长，吸引了国际合作者的兴趣。
介绍
克里斯·奥斯汀博士于2017年底建立了迪肯基因组中心。1起初，它有一个MiSeq™系统来支持测序项目。MiSeq系统最初用于微生物测序和浅层基因组测序。很快，迪肯基因组中心收到了更大、更雄心勃勃的项目的请求，超出了MiSeq系统的能力。他们开始将测序外包给HiSeq™Systems的服务提供商。虽然数据质量很好，但这是一个昂贵的选择，周转时间很长。
奥斯汀教授说:“我们意识到，最好购买一个高通量下一代测序(NGS)系统，它可以扩大规模，用于更大的测序项目。”“我们还需要一个系统，可以支持多种应用，包括靶向、全基因组测序(WGS)、全外显子测序(WES)和RNA-Seq。我们得到了Illumina公司MiSeq系统的良好支持。这让我们有信心选择NovaSeq 6000系统。”
提供超过高通量测序
NovaSeq 6000系统不仅仅提高了迪肯大学的研究能力。基因组学副教授兼迪肯基因组学中心经理拉里·克罗夫特表示:“这使我们能够将NGS纳入我们的教学计划。今天，我们的本科生和研究生可以进入实验室，学习如何进行图书馆准备。他们可能不会按下所有的按钮，但他们可以看到NovaSeq 6000系统的能力，并yobet亚洲了解NGS和基因组学的整个概念。”
NovaSeq 6000系统还支持迪肯基因组中心作为基因组中心的发展。“我们在澳大利亚主要城市之外拥有唯一的NovaSeq 6000系统，”奥斯汀教授说。“它已经成为迪肯研究人员的一个有价值的平台，也是吸引国际合作者和参与研究合作伙伴的重要资产。除了在基因组学方面与我们合作，他们还把学生和工作人员送到迪肯大学(Deakin University)接受培训。这是我们从新的基础设施和NovaSeq 6000系统中受益的另一种方式。”
加速在迪肯大学和全球的研究
利用Novaseq 6000系统，Deakin Genomics中心正在按比例进行测序。“我们可以做得不仅仅是基因组大会，”奥斯汀教授补充道。“我们可以同时对数千种不同个体的样本进行WGS或进行浅浏览速度测序以支持选择性育种和演化研究。它是多样的，使我们也能执行RNA-SEQ。“
“我们可以同时对数千个不同个体的样本进行WGS，或者进行浅撇测序，以支持选择性繁殖和进化研究。”
易于使用的系统使新员工能够学习如何快速操作。yobet亚洲“图书馆准备也很快，其吞吐量是现象，”克罗夫特教授说。“在两天内，它可以只在一个流动细胞上产生几乎四个数据的数据。从理论上讲，我们可以每两天生产八个数据。这是我们能力的大规模变化。除了测序一个基因组，我们可以同时考虑测序数百甚至1000个基因组。“
克罗夫特副教授喜欢该系统提供的同时运行多个项目的灵活性。“我们可以在四个不同的流单元通道上加载许多不同项目的样本，”克罗夫特副教授补充说。“在一次试验中，我们可以用不同片段大小的样本混合进行转录组测序和基因组测序。”
更低的测序成本吸引了更多的项目
NovaSeq 6000系统大大降低了迪肯基因组中心的测序成本。“这激发了使用测序的新可能性，”克罗夫特副教授说。“在NovaSeq 6000系统投入使用一年之后，我们有90个独立的项目正在进行中。到明年，我们希望有200-300个测序项目。我们还没有达到NovaSeq 6000系统生成数据的能力。我们正在确保我们有实验室的基础设施，特别是生物信息学人员来应对这种增长。我们还需要一段时间才能摆脱NovaSeq 6000系统。
支持新的研究
根据Austin教授的说法，“NovaSeq 6000系统创造并支持了许多新的研究机会。我们正在回答重要的问题，并为那些可能无法解决的关键问题找到答案。没有它，我们的研究将是相当乏味的。我们将在更小的规模上执行更少的项目。”
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引用:
- 迪肯基因组学中心。迪肯大学。www.deakin.edu.au/life-environmental-ciences/facities/deakin-genomics-centre。进入2019年4月2日。