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贝克的混合动力优化其实验室工作流程

通过增强的样品跟踪和精简的吞吐量获得更高的效率。

贝克的混合动力优化其实验室工作流程

介绍

贝克杂交种子公司成立于1937年,是美国最大的家族所有的零售种子公司,服务于中西部和邻近地区的农民。贝克在农业和杂交发展方面有100多年的历史,它帮助农民控制一些与农业有关的未知因素,以提高作物的质量和产量。它与育种家合作,利用二倍体技术和全基因组选择来整合所需的性状。与其他种子公司不同的是,贝克拒绝向缺乏农户对农户服务的大公司出售种子,而这种服务已成为贝克的标志。作为一个相对较小的组织,Beck创造性地使用其资源。该公司最近加强了研究业务,聘请了一名实验室经理,并开始使用BaseSpace Clarity实验室信息系统(LIMS)来优化实验室工作流程。

珍妮·塔尔(Jenni Taller)是贝克混合动力车总部位于印第安纳州亚特兰大的实验室经理。

了解情况

新聘的实验室经理詹妮·泰尔(Jenni Taller)是一个部门的一员,必须快速工作。她需要组织实验室,为样本量的大幅增长做好准备。托尔建立了一个电子表格系统,她称之为“漂亮”,但这很快就变得难以获取。信息也在以她无法跟上电子表格驱动的工作流的速度发展。托尔回忆说,她从育种者那里收到了不同格式的样本信息,要求她重新格式化数据,使其与电子表格保持一致。过了一会儿,她花了太多的时间在电脑前。她意识到获得LIMS将是她组织资源有限的实验室的最佳方式。

为了指导LIMS的购买,Beck的实验室团队创建了一个需求列表。无论他们选择什么LIMS,都必须帮助他们从一端到另一端跟踪样品,并为材料比较保持良好的记录。因为Beck的运行是精益的,所以它也必须易于管理、定制和维护。Taller也想实现无纸化。“我不喜欢砍树!”“强调高。除了这些重要的要求之外,Beck购买的任何系统都必须是价格合理的。最终,他们选择了BaseSpace Clarity LIMS。

BaseSpace Clarity LIMS使贝克的小型研究实验室能够以最佳的种子质量、田间表现和服务对农民产生积极影响。

播下成功的种子

在贝克,时间是按生长季节计算的,主要是玉米、大豆、小麦、紫花苜蓿和覆盖作物。任何时候停产都有可能影响一个生长期。因此,BaseSpace Clarity LIMS必须快速启动并运行。

标准BaseSpace Clarity LIMS实施包括一个专门的团队,负责实施该系统。现场应用专家(FAS)是该团队的重要成员。甚至在BaseSpace Clarity LIMS实施之前,FAS就与Higher会面,以了解团队的工作流程和需求。到了实施的时候,FAS帮助建立了一个初始的工作流程。训练立即进行,据塔勒说,他们在两周内开始运作。

消除挑战

Beck的旅程并非没有挑战,但BaseSpace Clarity LIMS帮助解决了这些问题。在实施后不久,实验室的主要检测试剂盒被供应商停止使用。贝克联系了它的饲养员,分享了这一消息。总的来说,我们决定利用退役的样本工具包来获取更多的样本信息,并增加样本吞吐量。几天之内,Beck决定使用Illumina Infinium®玉米球。BaseSpace Clarity LIMS标准化了40多个预配置工作流,包括Infinium。因为新的样本很快就会出现,所以团队很快在BaseSpace Clarity LIMS中构建了一个新的工作流程,并在一周内投入运行。

培育美好未来

在未来的一年里,贝克公司计划将其样品产量增加两倍,并期待更有效地处理更多的样品,为其农民客户生成有价值的基因型数据。Beck将其平滑扩展到BaseSpace Clarity LIMS的能力归功于其从Illumina获得的支持水平。

为了适应样品处理量的巨大增加,贝克公司雇佣了额外的实验室人员。根据Beck实验室团队的说法,BaseSpace Clarity LIMS工作流和样本管理使得培训过程变得简单明了。

BaseSpace Clarity LIMS如何在Beck的混合动力车中发挥作用:
  • 优秀的样本跟踪

    据Taller所说,她“生活在操作界面中”。如果有人问她是否运行了12003号样品,她可以在BaseSpace Clarity LIMS中快速提取样品,并查看从采集到结果的历史,包括何时和谁处理了它。追踪样本的能力也帮助Taller实现了无纸化。

  • 价格合理的LIMS解决方案

    Beck的主要需求之一是获得一个负担得起的LIMS解决方案,而BaseSpace Clarity LIMS已经满足了这一需求。

  • 易于配置、扩展和管理

    据泰尔说,她对“黑屏和学习如何编写代码”不感兴趣,而对于BaseSpace Clarity LIMS,她也不必这么做。易于配置的界yobet亚洲面使授权实验室人员能够在不需要软件编程知识的情况下更改工作流。在Illumina支持团队的帮助下,贝克还使用应用程序编程接口(API)扩展了系统。

  • 大力支持

    从实施前到日常使用,以及其间的所有情况,Illumina支持团队都会提供帮助。当使用BaseSpace Clarity LIMS时,泰尔觉得“贝克的电话离解决我们面临的任何问题或挑战只有一个Illumina电话。”

yobet亚洲亚博官网人口了解有关本文中提到的Illumina产品的更多信息:

BaseSpace Clarity LIMS软件,www.169o.com/informatics/research/sequencement-data-analysis-management/genologics-LIMS.html

MaizeLD BeadChip Kit, www.169o.com/products/by-type/microarray-kits/maize-ld.html