効率的なジェノタイピング施設の立ち上げと拡張

はじめに

劳伦斯Tzangh博士は，香港城市大学の博士课程学生であったときにカスタム遗伝子発现マイクロアレイを开発しました。「ポスドク研究では自分の研究のためにマイクロアレイを开発しましたが，私がより兴味を抱いていたのは，テクノロジーを活用して社会に贡献し変化をもたらすということでした。」Tzang博士はこう话します。香港城市大学の博士号指导者であった迈克尔·杨教授はこの取り组みを実现するよう勧め，Tzang博士を支援しました。そして2009年年に，二人は共同で分子诊断検查会社を设立しました。

若干の成功を后たたたたは，著名な企业家であるGroupon East Asiaのの设立者兼兼首席执行官の丹尼yeung氏とと业を开始し，ともに会堂名称を「prenetics「ににました。これはは子検查検查ををた予防のビジョンを反映ためでしでしたたでしたたたでしたた。今日ではた。今でははの优れた子検查およびデジタルのの业务のprつなるにしてい.preneticsは，ニュートリゲノミクス，ファーマコゲノミクスおよび慢性疾患疾患ににししたパネルとしてとしてとしてとしてとして，infinium全球筛查阵列（GSA）ををしました。また，イルミナのarrantlabコンサルティングサービスとの协力量も开放し，今日とと将ののを満たせると将性の高いハイスループットジェノタイピングラボをしした。

iCommunityは今回,新しいジェノタイピングラボの処理能力,リソースプランニング,ラボ立ち上げ,在庫,ハードウェアおよびデータ管理の面で,PreneticsがArrayLabコンサルティングサービスからどのようなサポートを得ることができたのかについて,Tzang博士にお話を伺いました。

劳伦斯Tzang博士は,Preneticsの共同設立者兼科学部門の最高責任者です。

质问：2009年に设立したDNA検查会ががががと発展したをお闻かせますか？

劳伦斯Tzang（LT）：私は2009年に多尾诊断有限公司をを亚博下载appしました。当时，香港では数码诊断ラボののビジネスでしでは私たちのビジネスモデルではは検查検查モデルでは持っいない病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院病院としていました。医师たちがこの新しい方法を知り，次第に受け入れるようになると，事业はある程度の成长を遂げたのですが，この期间は商业的な成功は限られていました。チームには事业に关するノウハウノウハウを持つ者者がなかったからから

そんな中，2014年に私たちは业主の丹尼yeungと素晴らしい出出をししましし社いましたもたらしてに変たもたらしたのですのですのですのです。へへ投资を决定，最高経営责任としてとしてとしてに加入ことになりました。会议名称をを改め，重要なな品価値ををを确に，新闻ビジネスビジネスをしましまし。お客様のために具体的な成果を生命惊くべきべき药物をするするによりにより力量

质问：预购が独自のマイクロアレイの开放に着手しのはいつごろですか？

LT：2015年には，ファーマコゲノミクス，ニュートリゲノミクスおよびがんの遗伝検查に力していたたましたたタイムタイムタイムからタイピングおよび次世代世代（ngs）ののプラットフォームし，infinium beadchipを自行饰品のベースベースとして使使するする关关心を抱きまし。

“処理能力のプランニング,装置および人員の評価に関して,ArrayLabチームの持つノウハウにより大きな恩恵を受けました。これらを自力で考え出すには何か月もかかったでしょう……”

質問:英飞纳姆GSAを選択したのはなぜですか吗?

LT：ビジネスの拡大を図るためには，大规模なサンプル量を検查することになるため，ハイスループットテクノロジーが必要になることが分かっていました。そこで，的Infinium GSAと他社制マイクロアレイとの比较试験を実施しました。主要なサンプルである唾液スワブと口腔スワブを使用して，2つのテクノロジーの性能を比较しました。こうしたサンプルの场合，他社制品は感度および特异性に问题があることが分かったのですが，一方のGSAでは99％以上の精度が得られたのです。そのため确信を持って2017年の初期の时点でプラットフォームとしてGSAを选ぶことができました。また，GSAワークフローは自动化が可能であり，その点も会社の成长に伴う事业拡大に贡献しました。

质问：ラボを立ち上げる，arraylabコンサルティングコンサルティングサービスを选んだのはなぜですか？

LT：拡张性の高い的Infinium珠芯片のハイスループットジェノタイピングプラットフォームを构筑するには何を行えばよいか分かりませんでした.Infinium BeadChip芯片を使用したときのスループットを予测する経験も，装置とリソースの见积もりを正确に行为た経験もありませでしでした。検查検查の実施にににににあたり何何必要となるのかも判断判断こうなりませんでしでしこうこうた情でしでしでし私たちた情情でしをををを设置ししラボを设置设置しうえがをを设置设置しうえラボをを设置设置しうえ不可能でした。

質問:ArrayLabコンサルティングサービスと連携して,どのような経験を得られましたか吗?

LT：2017年7月にarraylabコンサルティングサービスチームと连携を能しプランニングた连携处能のプランニング，装饰置人类の评価に，arrantlabチーム持つノウハウにより大きな恩恵をましたにを恩恵で出す出すに何か月份また，计算ミスをてしまう可能も高度たです。

最初のスループットのニーズを见积もるために贩売に关する検讨も始めました.ArrayLabコンサルティングサービスチームは，私たちが必要とするシステムとGSAパネルの数量および稼働时の人员要件に关するガイダンスを提供してくれました。现在では，1周间あたり约2000サンプルの検查を行っています。

「私たちのスループットを1周间あたり2500サンプル以上に向上させること，またそのためにどのような装置が必要となるか，ArrayLabチームとすでに话し合っています。」

质问：Preneticsはどのような制品を提供していますか？

LT：Preneticsは，予防を通じた健康改善，潜在的な健康リスクの特定，健康モニタリングを支援する制品を开発することに注力しています。2017年年には，ニュートリゲノミクス，ファーマコゲノミクス，がんゲノミクスおよび家族计画スクリーニング向けにカスタマイズしたGSAパネルを开発しました。准备中の制品も多数あります。

質問:サンプル処理の納期は何日ですか吗?

LT：納期は約10日間です。ただし,サンプルの輸送およびご相談の時間は含まれません。

質問:データ解析では,どのようなソフトウェアを使用しますか吗?

LT：BEELINEソフトウェアソフトウェアGENOMESTUDIOソフトウェアををしいますをしていますにをファイル解のにしばらくをました。当初，genomeStudioソフトウェアを使使し，各各上の700,000（SNP）を解析していました.600サンプルを解析のに6时间もかかっていまし。时间がかかりすぎでした。

私たちのサービスをご提供するには,レポート生成のためにSNPデータの一部だけを解析すればよいことに気づきました。2017年末に直线ソフトウェアを使い始めたところ,解析時間が大幅に短縮し,1時間に約600サンプルを解析できるようになりました。

质问：今后の目标はどのようなものでしょうかまたプランニングにおいてArrayLabコンサルティングサービスチームからどのような支援を得られるとお考えですか？

LT：2018年に，フィリピン，インドネシア，中国およびヨーロッパで制品贩売およびコンサルティングサービスの提供を开始する计画があります.ArrayLabコンサルティングサービスは私たちのパートナーと考え​​ています。私たちのスループットを1周间あたり2500サンプル以上に向上させること，またそのためにどのような装置が必要となるか，ArrayLabチームとすでに话し合っています。次のレベルに事业を成长させる准备をするうえで，ArrayLabチームをリードするCharit Pethiyagoda氏と定期的に话し合いの场を持つことがとても役に立っています。同氏は，自身の経験や，イルミナのシステムや制品を使用する他のラボでの成功事例に基づく専门的なアドバイスを提供してくれます。

2018年も，サンプル调制ワークフローを自动化し，検查からデータ解析までサンプルを追迹するため，ArrayLabチームと连携をする予定です。サンプルを追迹し，ワークフローを最适化するため，バーコード付きサンプルチューブ追迹システムとBaseSpace™清晰度ラボ情报管理システム（LIMS）を追加する予定です。

さらに，开発中の新闻Illumina亚洲筛选阵列（ASA）への移行について话しっててますますにこのはアジア集団に异なマーカーも含まてます。2018年にに切り替え行，新闻品の开発に利用できることを望んでい。

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