10年的基因组选择为加拿大奶农带来了实实在在的回报
生产力的提高和小母牛的选择推动了农场的效率和竞争力。
十年基因组选择为加拿大奶农提供加速改善和有形回报
介绍
加拿大乳制品网络（CDN）是加拿大奶牛遗传评价中心，为该国所有乳制品提供基因组数据管理，分析和出版物服务。CDN于1995年开始运营，自一天以来由Brian Van Doormaal进行管理。他记得近15年的职业生涯，基因组学袭击加拿大乳业行业“像一个大爆炸”。从那时起，他通过增加参加牧群基因分型的乳制品农场的百分比增加了基因组数据增长和利用的成功计划。
布莱恩·安德森是第五代奶农。这家家族企业位于安大略省，占地600英亩，拥有300头牲畜。作为Athlone农场的育种运营负责人，他拥有利用基因选择来改善畜群的直接经验。他还是CDN基因评估委员会的成员，该委员会就当前的基因和基因组评估活动向该组织提供建议，并帮助奶农从基因组信息中获利。
“乳制品业是一个艰难的行业，”Van Doormaal说。“每个农民都需要找到一点额外的优势，让他们的牧群有利可图。”
2019年，CDN将庆祝支持加拿大奶牛基因组选择10周年。iccommunity采访了Van Doormaal和Anderson，了解CDN的成功，该组织的奶牛yobet亚洲基因组数据库的持续增长，以及它对加拿大奶农的价值。
Brian Van Doormaal是加拿大乳业网络总经理，Brian Anderson是Athlone农场乳制品农场的共同主，加拿大安大略省Tavistock。
问：CDN在加拿大乳品行业扮演什么角色？
Brian Van Doormaal (BVD):加拿大乳品业由大约100万头奶牛和45万头小母牛组成。它总共包括近11000只畜群，其中约75%的畜群参与了我们的品种改良计划。我们的职责是对个体动物（雄性和雌性）进行基因评估，并管理乳制品动物基因型数据库。
第一批动物是在2008年进行基因分型的。今天，大约10%的新生小母牛进行了基因分型，我们现在有235000只加拿大动物的数据。我们与美国共享一个基因型数据库，因此CDN的奶牛DNA数据量很大。我们现在总共有300多万种基因型，包括来自几个不同国家的乳制品。
几年前，我们推出了Pro$，这是一项针对奶农的国家遗传选择指数，旨在优化农场盈利能力。我们的目标是帮助奶农在降低成本的同时最大限度地延长牛的生产寿命。
问：加拿大是如何进行基因组测试的？
BVD：基因组测试由CDN成员行业合作伙伴提供，主要是荷斯坦加拿大，通过一些人工授精（AI）中心。他们在农场工作介绍技术，并鼓励农民学习和理解基因组测试如何具有价值。yobet亚洲
为了获得用于测试的DNA，他们通常会拉扯小母牛的毛发或使用组织样本。这些样本被送到实验室，通常是在美国，然后在这个过程中得到的基因型数据就会得到CDN。
“基因组学是我们交配策略的下一步，因为它提高了我们一直使用的工具的准确性。”
问:对奶农来说，哪些遗传特征是重要的?
布莱恩安德森(BA):我们希望通过基因组学来改善功能特性，如群体寿命、体细胞计数和蹄健康。基因组学的准确性使我们对培育一头更好的奶牛更有信心。
BVD：饲料转化率，或者说饲料效率，是我们在基因组学中可以选择的，这是我们在10年前从未考虑过的。饲料是奶牛场所有成本的重要组成部分。如果每只动物的饲料转化率较高，农民最终会获得更多的利润。
经济学和法规正在改变我们的重要特征。如果我们回到50年前，唯一重要的特征是高牛奶产量。现在我们关注的是寿命、繁殖能力、抗病能力，以及任何影响奶牛养殖成本的因素。
问：奶农如何使用基因组信息？
BA：当我开始耕种时，我们每次哺乳期间有4500公斤的产量，今天我们率约为10,500公斤。奶牛的构象，价值和寿命生产力大大提高。通过选择蹄和抗病性等特征，奶牛的福利得到了大大改善。更好的疾病抵抗降低了我们的成本和抗生素的利用率。我们有非常高效的动物，但基因组学有助于我们养殖牛奶的奶牛。在未来的某个时候，生产可能会再次倍增。
“农民不需要等待5-6年，公牛才能成为后代…”
基因组学是我们交配策略的下一步，因为它提高了我们一直使用的工具的准确性。在我开始乳品业之前，我父亲去人工智能中心买了最好的牛的精液。四十年前，我们转向了纠正性交配，我们试图选择有特点的公牛来补充我们的牛群。这种策略已经发展了多年，随着基因组学的准确性，我们现在可以识别出具有帮助我们牧群的基因的动物。
基因组测试是识别和集中在我们的优质动物上的好方法。我们正在使用基因组学识别我们可以使用更昂贵的精液的动物。现在基因分型的成本较低。做基因组测试比养动物的要更便宜，从现在开始两年，她真的不衡量。我们拥有良好的牧群横断面测试，现在我们正在统一地测试我们的年轻动物。
BVD：基因组测试确认了动物的亲缘关系并估计了其遗传潜力。在许多农场，在某一天出生的小牛太多，无法正确识别父母，或者多次授精无法识别父系。在加拿大，每一种被基因分型的动物最终都会对其父系和母系进行自动亲子鉴定。农民利用这些信息来确定动物的实际价值。有了这些信息，他们可以更好地决定是出售、繁殖还是投资。
饲养一头小母牛的成本是极其重要的，特别是与对小牛进行基因分型的成本相比。除了帮助农民确定需要投资的动物外，基因测试还可以识别携带不良基因的小母牛。你可以通过与非携带者交配来避免影响下一代。
当一头公牛在农场出生时，人工智能公司可以对它进行基因分型，并对它从父母那里继承的DNA有一个极好的了解。我们可以测试具有相同父母的亲生兄弟，并确定与遗传正确基因包的动物相比，基因包较差的动物个体。农民不需要等待−6年后，这头公牛将成为广泛使用精液的“后代”。
“每个农民都需要找到一点额外的优势，让他们的牧群有利可图。”
问:拥有一个大型基因组数据库的重要性是什么?
BVD：加拿大的奶牛场场主最初是通过对繁殖出高性能女儿的公牛进行基因分型而认识到基因组学的力量的。后代证明的父系参考种群越大，从基因组学中获得的精度就越高。在过去的十年中，我们了解到，通过扩大参考种群，包括奶牛，yobet亚洲可以获得额外的准确性。基因组学在父系和奶牛身上的应用越广泛，对整个行业的好处就越大。
加拿大94%的牛是荷斯坦牛，该品种有最大的基因组选择参考种群。因此，我们知道荷斯坦小牛的基因组成有70%的可靠性，而仅知道其父系和母系的可靠性只有35 - 40%。在参考种群较小的品种中，可靠性的增益不那么强。更多的基因组检测扩大了参考人群，增加了回报。
问：奶牛基因组学的广泛应用还有哪些障碍？
BVD：AI中所有可用的公牛都是基于基因组学选择的。因此，无论农民是否知道，他们都在做出育种决定，这是基因组选择的结果。在过去的10年里，我们已经证明了所有性状的选择都是可能的。了解女性基因分型的好处仍然是一个障碍。
在一些农场，对每头小母牛进行基因分型是标准的操作程序。其他农场正试图找出一小部分小母牛进行检测，以优化其基因分型投资的回报。在CDN，我们正在与Holstein Canada合作开发一个软件工具，帮助农民就如何采用基因分型技术做出最佳决策。
BA：当我第一次学习基因组学时，yobet亚洲我觉得它可能是有价值的东西。经过两代之后，很容易看到估计的育种值(EBV)更加准确。有时候，这只是你自己去看的问题。
“在基因组选择方面，我们将有一个最大的机会，那就是分离存在于积极和消极特征之间的传统关系。”
问：奶牛基因组学的未来是什么？
BVD：在过去的几十年里，我们记录了乳腺炎抗性的标准性状，如产量、身体构象和体细胞计数。自从基因组选择在加拿大出现后，我们一直在研究上投入资金。我们现在可以证明，基因组选择性状有潜在的好处，我们以前从未考虑过。其中一些特性与动物本身有关——抗病、长寿、灵活和跛足。然而，消费者购买的乳制品还有其他重要特征，如酪蛋白成分、乳糖、脂肪酸和胆固醇含量。我们已经证明，这些产品的一些性状有遗传力。我们有机会利用基因组选择来关注乳制品的营养特性。
基因组选择带来的最大机遇之一就是将存在于积极和消极特征之间的传统关系分离开来。例如，高产动物传统上在生育方面有更多的困难。如果我们能识别出那些携带高产基因和良好繁殖能力基因的动物，我们就能将更多这样的动物引入我们的种群。
BA：展望未来，我们还将关注甲烷的生产和我们在农场的碳足迹。基因组学将帮助我们识别从饲料中产生较少甲烷的动物。更高效的动物和更高的产奶量是我们可以期待的未来特征。