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FFPE样本分析

FFPE样品的简单分析

专门旨在满足利用福尔马林固定的石蜡嵌入式(FFPE)样品进行遗传分析的挑战,FFPE溶液的Illumina产品组合提供了全面的FFPE测序和微阵列应用。这些解决方案利用了FFPE样品的优化工作流程和技术,其通常含有部分降解或有限的基因组材料。研究人员现在可以分析先前无法访问的样本以导出高质量的基因组数据和洞察力。简单的准备方法,创新的下一代测序和阵列平台,直观的数据分析工具有助于FFPE样品测序和阵列研究。

用于FFPE测序的QC方法

一种新的QC方法使研究人员能够成功地对FFPE肿瘤样本中的降解DNA进行测序。

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有针对性的DNA测序

有针对性的测序重点是一组精选的基因或基因区域,选择的基础先天的知识。通过测序靶向DNA区域,研究人员可以使用流线型数据分析管道进行成本效益,高度测序。

为了促进靶向癌症FFPE测序研究,Illumina提供了保证性能的固定面板,以及定制的扩增子解决方案,研究人员可以选择他们感兴趣的扩增子。

170年TruSight肿瘤是一个综合的研究面板,可检测到从40 ng核酸的实体肿瘤进展有助于实体肿瘤进展的单核苷酸变体(SNV),扩增和诱导,并且与低质量的FFPE样品相容。

TruSight肿瘤15能够从FFPE组织样本中对实体肿瘤样本进行分子图谱研究,为微小等位基因检测提供了高水平的敏感性。

AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2:针对已知与癌症相关的50个基因的热点区域进行调查的目标研究小组。

Illumina综合癌症小组的AmpliSeq:用于调查已知与癌症相关的409个基因的外显子区域的靶向研究小组。

500年TruSight肿瘤学:针对多种变异类型的检测,包括肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI),甚至来自低质量样本。

FFPE样品QC建议

FFPE组织的提取方法通常产生高度降解的DNA和RNA。阅读我们的FFPE质量控制建议,以确定您的FFPE样品是用于Illumina文库制备套件的可行输入材料。

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FFPE样品QC建议

RNA序列

通过我们的RNA测序(RNA- seq)文库准备试剂盒,在转录本水平准确测量基因表达,并发现基因融合,用于FFPE测序研究。

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FFPE肿瘤样本测序

研究人员对FFPE肿瘤样本进行测序,以确定驱动基因和新的生物标志物。

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特色RNA-Seq解决方案

Trusight RNA泛癌板能够全面检测1385个基因融合和基因表达变化,为研究人员聚焦癌症发生的功能相关变化。该面板与FFPE组织兼容,可容纳FFPE输入的总RNA仅20 ng。TruSight RNA泛癌小组为研究癌症的表达动态和功能机制提供了一种敏感、可重复和经济的解决方案。

170年TruSight肿瘤是一个综合的研究面板,可检测到融合和接头变化(以及其他变体类),其有助于从40 ng的RNA和/或DNA的实体肿瘤进展,并与低质量的FFPE样品相容。

Illumina RNA浓缩Prep允许您实现快速,有针对性的讯问大量的目标基因与卓越的捕获效率和覆盖均匀性。

Illumina链总RNA Prep与核糖零度加提供快速的库准备从广泛的样本类型研究编码和非编码转录组无与伦比的研究灵活性。

有针对性的RNA序列是一种准确且经济的方法,可同时测量数十几种RNA靶标的方法,使其是从基因表达阵列和RNA-SEQ研究中确认结果的理想选择。

基因分型

Illumina定制,半定制和市售数组可用于基因型FFPE样品。此工作流利用该工作流程无限FFPE DNA修复液,通过识别足够质量的样本并修复样本中受损的DNA以进行下游基因分型,简化了前期样本处理。

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甲基化数组

甲基化阵列使得在单核苷酸分辨率下,可以在基因组上进行定量询问选定的甲基化位点。Illumina甲基化阵列提供了独特的全面,专家所选覆盖,FFPE样本兼容性,高样品吞吐量以及实惠的价格组合。

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