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低质量/ FFPE RNA-Seq解决方案

FFPEサンプルのRNA-Seq解析を実現

FFPEサンプルや低品質サンプルの核糖核酸シーケンス(RNA序列)解析からは、疾患研究のための貴重な洞察が得られます。 残念なことに、この貴重なデータのほとんどはこれまで入手不可能でした。 現在はイルミナが最近開発したFFPE RNA序列ソリューションにより、重要なデータの入手が可能になり、分解したサンプルから高品質な結果が得られるようになりました。

ウェビナー: FFPE RNA序列

FFPE RNAシーケンスにおける障壁を克服する方法についてはこちら。

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FFPEサンプルおよび低品質サンプルのmRNA序列

信使rnaシーケンス(如下)は、コーディングトランスクリプトームを解析する正確かつ費用効果の高い方法です。 シーケンス予算をメッセンジャー核糖核酸だけに集中させることにより、選択的スプライシング、融合転写産物、およびコーディングバリアントなどの新規特性の発見を可能にする一方で、サンプルスループットが向上し、サンプルあたりの費用を削減できます。

TruSeq RNA外显子组は,従来のポリ一を用いてコーディングトランスクリプトームを捕捉する方法の限界を克服しています。これらの従来法はFFPE RNA-Seq解析には役に立ちません。ポリアデニル化された転写産物の存在に頼らない配列特異的濃縮法を適用しているため,TruSeq RNA访问はFFPEサンプル,分解したサンプル,出発物質の量が限られるサンプルのmRNA-Seqに最適です。

特色RNA-Seq研究

破译长链非编码RNA在癌症中的作用
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研究人员正在使用RNA-Seq来揭示lncrna如何用于识别、测量和治疗癌症。

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两个RNA库准备工具的故事
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两种流行的TruSeq RNA文库制备试剂盒之间的关键比较揭示了进行RNA测序研究的研究人员感兴趣的新信息。

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RNA测序方法综述
RNA测序方法综述

此集合包含协议图、优点和缺点,以及RNA-Seq的相关同行评审出版物。

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FFPEサンプルおよび低品質サンプルの总RNA-Seq

总RNAシーケンスでは,トランスクリプトームの全体像を非常に良好に把握することができるため,1回の実験でコーディングRNAとさまざまな形態のノンコーディングRNAの両方を解析することが可能です。

总RNA-Seqでは,非常に正確な転写産物存在量情報が得られ,さらに遺伝子融合,転写産物アイソフォーム,cSNPs,およびアリル特異的発現などの新規特性の検出も可能になります。

TruSeq链总RNA文库制备试剂盒は,実証されたサンプル調製とリボソームRNA除去ケミストリーを一つにした効率的なソリューションで,FFPEやその他の低品質サンプルおよび通常のサンプルを対象としたRNA-Seqによる頑健な全トランスクリプトーム解析です。

FFPE RNA序列的QC建议

FFPE组织的提取方法通常会产生高度降解的RNA。请阅读我们的FFPE质量控制建议,以确定您的FFPE样品是否是Illumina文库制备试剂盒的可行输入材料。

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FFPE RNA序列的QC建议

ターゲットRNAシーケンス

ターゲットRNAシーケンスは、目的の転写産物の発現を測定するための非常に正確で特異的な方法で、定量的情報と定性的情報の両方が得られます。 差次発現解析、アリル特異的発現測定、そして融合遺伝子の存在の検証を可能にします。

特拉西特肿瘤170は,固形腫瘍の悪化に寄与する融合およびスプライスバリアント(およびその他のバリアントクラス)を40 ngの核酸から検出でき,低品質FFPEサンプルにも対応する包括的なパネルです。

TruSight RNA泛癌小组1385年によりの遺伝子融合および遺伝子発現の変化を包括的に検出して,がんにおける機能的に重要な変化の発生を重点的に観察することができます。このパネルはFFPE組織に対応しており,わずか20 ngのFFPE由来总RNAで解析を行うことができます。TruSight RNA Pan-Cancerパネルは,発現ダイナミクスおよびがんの機能的メカニズムの研究に適した,精度および再現性の高い経済的なソリューションです。

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