质量分数排序简介
测序质量分数衡量一个碱基被错误调用的概率。通过合成排序（SBS）技术，读取中的每个碱基通过类似phred的算法分配一个质量分数1,2，类似于最初为Sanger测序实验开发的。
测序技术视频
了解Illumina SBS的工作原理。
Q分数定义
给定基数的排序质量分数Q由以下等式定义：
Q=-10log10（e）
其中e是基本呼叫出错的估计概率。
- 更高的Q分数表示错误概率较小。
- 较低的Q分数可能导致大部分读取无法使用。它们还可能导致假阳性变异呼叫的增加，从而导致不准确的结论。
如下所示，质量分数为20表示错误率为1/100，相应的呼叫准确率为99%。
| 质量分数 | 错误基本呼叫的概率 | 推断基本呼叫准确度 |
|---|---|---|
| 10（Q10） | 十分之一 | 90% |
| 20（Q20） | 百分之一 | 99% |
| 30（第30季度） | 千分之一 | 99.9% |
Illumina测序质量分数
Illumina测序化学提供高精度，绝大多数碱基得分为Q30及以上。这一精度水平非常适合于一系列测序应用，包括临床研究。
yobet亚洲了解为什么PhiX可以用作Illumina NGS运行质量监控的运行控制。
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工具书类
- Ewing B，Hillier L，Wendl MC，Green P.（1998）：使用phred的自动定序器跟踪的基本调用。I.准确性评估。基因组研究8（3）：175-185
- Ewing B，Green P.（1998）：使用phred的自动定序器跟踪的基本调用。二,。错误概率。基因组研究8（3）：186-194