シーケンスプロジェクトを計画する際には,主要な用語と重要な概念を明確にする次世代シーケンス用語集をご利用ください。
既知のリファレンス塩基にアラメントされる(塩基を"カバ"する)シケンスした塩基数の平均値。例えば,全ゲノムを30×カバレッジでシーケンスした場合,ゲノム内の各塩基を平均で30回シーケンスしたことを意味します。カバレッジレベルが高くなるほど,信頼度の高いベ,スコ,ルが行われます。
詳細はこらゲノムDNAサンプル(またはcDNAサンプル)をシーケンスライブラリーに変換する分子生物学プロトコールです。これによってngs装置でシ,ケンスできるようになります。ラ▪▪ブラリ▪▪調製の最初のステップはDNAサンプルのランダムな断片化で、その後各DNA断片に5'または3'アダプターをライゲーションします。代替法の「タグメンテーション」は、断片化反応とライゲーション反応を1つのステップにまとめたもので、ライブラリー調製プロセスの効率を大幅に向上します。
詳細はこらライブラリー調製時に,固有の短いDNA塩基配列(“インデックス”)を各DNA断片に付加するプロセス。。1つにまとめられたライブラリーのシーケンスリードは,最終的なデータ解析の前にコンピューター処理によって識別され選別されます。ライブラリーのマルチプレックスは,スモールゲノムを扱う際や目的とするゲノム領域をターゲット化する場合に有効なテクニックです。マルチプレックスを行う場合、1回のランで解析するサンプル数が指数関数的に増えますが、費用や時間が大幅に増加することはありません。
詳細はこらシーケンスライブラリーの全DNA断片にまたがり各塩基位置でヌクレオチドA、C、G、Tの割合が等しいもの。カラバランスはルミナのシケンスシステムでメジ解析を効率的に行うために必要です。そのため,ほとんどのイルミナライブラリー調製ワークフローにはランダム断片化ステップが含まれており,ライブラリー内の各塩基位置で必要な塩基多様性を生成します。
報告書を見る同一のランで1のdna断片を両端からシケンスするプロセス。
詳細はこらベスコルにおけるエラ確率を予測または推定するngsのパラメタ。クオリティスコア(qスコア)は非常に小さなエラ確率を伝えるための方法になります。qスコアが高いほど,ベ,スコ,ルの信頼性が高く不正確さが少ないことを意味します。
詳細はこらすべてのi5 aapl . exeンデックスとすべてのi7 aapl . exeンデックスが1回限り使用されるようなaapl . exeンデックスペア。ユニクデュアルンデックスを用いると、インデックスホッピングがあるリードを識別して抽出できるため、マルチプレックスサンプルの信頼度がより高くなります。
報告書を見るゲノムのタンパク質コーディング領域(エクソーム)のみをターゲットにした広く利用されているシーケンス法。
詳細はこらリ,ド長,シ,ケンスカバレッジなど,最初のシ,ケンスランに必要なものすべてをご覧いただけます。
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