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作者是Illumina的首席医疗官Phil Febbo博士
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样本多路复用,也被称为多路测序,允许在Illumina仪器上的一次运行中同时对大量库进行池化和测序。当针对特定基因组区域或与较小的基因组一起工作时,样品多路复用是有用的。在不大幅增加成本或时间的情况下,池化样本会成倍地增加单次运行中分析的样本数量。
通过多重测序,在下一代测序(NGS)文库制备过程中,将单个“条形码”序列添加到每个DNA片段中,以便在最终的数据分析之前对每次读取的数据进行识别和排序。这些条形码或索引适配器可以遵循两种主要的索引策略之一,这取决于您的库准备工具包和应用程序。
研究人员利用Illumina测序仪的速度和多重测序能力来识别密西西比河沿岸的微生物。
在为多路复用准备库时,我们建议使用唯一的双索引。与其他索引策略相比,惟一双索引允许您增加每次运行排序的样本数量,并降低每个样本的成本。
独特分子标识符(UMIs)是一种分子条形码,可在测序过程中提供纠错和提高准确性。UMIs测序可以降低变异调用的假阳性率,提高变异检测的敏感性。
使用多路复用,索引跳变的潜力是存在的,无论库的准备方法或序列系统使用。yobet亚洲学习最佳实践以帮助最小化索引跳的影响。
陈-扎克伯格生物中心的研究人员正在进行创新实验,并在基因组学方面形成新的合作。NovaSeq系统使他们能够将许多样本捆绑在一起,用于可能有助于改善人类健康的医学研究。
NovaSeq 6000系统为几乎任何基因组、测序方法和项目规模提供可扩展的吞吐量和灵活性。
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Illumina测序使研究人员几乎可以提出任何与任何生物体的基因组、转录组或表观基因组相关的问题。
使用这个交互式工具来比较Illumina测序平台的关键特性,并确定最适合您需求的系统。