对测序质量评分的介绍
排序质量分数衡量的是一个基地被错误调用的概率。使用按合成排序(SBS)技术，读取中的每个碱基都由类似phred的算法分配一个质量分数1，2这与最初为桑格测序实验开发的方法类似。
测序技术视频
了解Illumina SBS如何工作。
问分数定义
给定碱基的测序质量评分Q由下式定义:
Q = -10日志10(e)
其中e是基本调用出错的估计概率。
- 更高的Q分数表示较小的错误概率。
- 问的得分越低可能导致很大一部分读取不可用。它们还可能导致假阳性变异呼叫的增加，导致不准确的结论。
如下所示，质量分数为20表示出错率为1 / 100，对应的呼叫准确率为99%。
| 质量分 | 基本呼叫错误的概率 | 推断基调用准确性 |
|---|---|---|
| 10 (Q10) | 1在10 | 90％ |
| 20 (Q20) | 在100年1 | 99％ |
| 30日(Q30) | 在1000年1 | 99.9% |
Illumina测序质量评分
Illumina测序化学提供高精度，绝大多数碱基评分Q30以上。这种水平的准确性是一系列测序应用的理想选择，包括临床研究。
yobet亚洲了解为什么PhiX可以用于Illumina NGS的运行质量监测的运行控制。
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参考文献
- Ewing B, Hillier L, Wendl MC, Green P.(1998):使用phred的自动音序器追踪的基础呼叫。即精度评估。基因组研究》8 (3):175 - 185
- Ewing B, Green P.(1998):使用phred的自动音序器追踪的基础呼叫。2错误概率。基因组研究》8 (3):186 - 194