帮助您可视化阵列数据并将结果转化为见解

微阵列服务培训材料

我们知道管理大型数据集是一项挑战。为了让您熟悉微阵列分析,Illumina提供全基因组基因分型和甲基化培训包。培训包包括用户指南、数据表和示例数据集。

该培训解释了GenomeStudio软件分析工具如何帮助您将数据转换为有意义的结果,用于您的基因组分析和研究。

可视化和分析你的数据

使用GenomeStudio软件可视化和分析Illumina微阵列平台生成的数据。

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GenomeStudio软件

通过查看一个包含12个人类多态研究中心(CEPH)样本的小样本集数据的GenomeStudio项目来熟悉我们的基因分型数据,其中包括使用Illumina HumanOmni5-Quad珠片进行基因分型的两个重复。该产品利用强大的标签snp,目标遗传变异到1%的小等位基因频率。

使用Infinium LCG测定,该四个样本珠芯片为全基因组基因分型和CNV应用提供高通量样品处理和优化含量。了解如何使用GenomEstudio,以优化样本的呼叫,并以可直接导入下游分析工具的格式运行报告。

找到HumanOmni5-Quad v1.0演示数据HumanOmni5-Quad v1.0支持文件Illumina阵列支持下载.有关产品内容的其他信息可在这里获得。

我们建议使用GenomeStudio GT模块v1.0用户指南有关软件中可用的功能以及如何以与下游分析兼容的格式导出数据的附加信息。

Illumina FastTrack服务分析方法

参见Illumina FTS如何使用GenomeStudio分析基因分型数据,以优化基因分型调用。

访问PDF

人甲基化450珠芯片允许研究人员以单核苷酸分辨率以每种样品询问超过485,000个甲基化位点。基因组甲基化数据分析模块计算甲基化水平(β值),并分析实验组之间的差分甲基化水平。单站点分辨率数据可以可视化为线图,条形图,散点图,直方图,树木图,框图或热图。演示数据集提供了中心D'Etude du多态性蜂窝(Ceph)样本的数据,包括两个重复,在人甲基化450珠芯片上运行。

找到HumanMethylation 450 Demo数据集提供下基因组软件2011.1GenomeStudio支持下载页面。这里提供了关于产品内容的附加信息。

我们建议使用GenomeStudio Methylation Module v1.8用户指南有关软件中可用的功能以及如何以与下游分析兼容的格式导出数据的附加信息。

分析Infinium项目

有关如何分析您的Infinium微阵列项目的更多信息,请参阅本培训课程。

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